From bench to bedside: Single-cell analysis for cancer immunotherapy.
From bench to bedside: Single-cell analysis for cancer immunotherapy.
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DOI：
10.1016/j.ccell.2021.07.004
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发表时间：
2021-08-09
期刊：
影响因子：
50.3
通讯作者：
Kagohara LT
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Davis-Marcisak EF;Deshpande A;Stein-O'Brien GL;Ho WJ;Laheru D;Jaffee EM;Fertig EJ;Kagohara LT
单细胞技术正在成为癌症研究的强大工具。这些技术表征了肿瘤内每个细胞的分子状态，使人们能够对影响治疗反应的肿瘤异质性、微环境细胞类型组成和细胞状态转变进行新的探索--特别是在免疫治疗的背景下。分析临床样本在精准医学方面前景光明，但在技术上具有挑战性。成功识别反应的预测因素需要协调良好的多学科团队，以确保充分的样本处理以生成高质量的数据，并为数据解释进行计算分析。在这里，我们回顾了当前的样本处理和计算分析方法，以及它们在转化型癌症免疫治疗研究中的应用。
Single-cell technologies are emerging as powerful tools for cancer research. These technologies characterize the molecular state of each cell within a tumor, enabling new exploration of tumor heterogeneity, microenvironment cell type composition, and cell state transitions that impact therapeutic response — particularly in the context of immunotherapy. Analyzing clinical samples has great promise for precision medicine but is technically challenging. Successfully identifying predictors of response requires well-coordinated, multi-disciplinary teams to ensure adequate sample processing for high-quality data generation, and computational analysis for data interpretation. Here, we review current approaches to sample processing and computational analysis regarding their application to translational cancer immunotherapy research.
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影响因子：
64.8
作者：
Cao, Junyue;Spielmann, Malte;Shendure, Jay
通讯作者：
Shendure, Jay
影响因子：
46.9
作者：
Becht, Etienne;McInnes, Leland;Newell, Evan W.
通讯作者：
Newell, Evan W.
影响因子：
64.5
作者：
Cleary B;Cong L;Cheung A;Lander ES;Regev A
通讯作者：
Regev A
影响因子：
48
作者：
Caicedo JC;Cooper S;Heigwer F;Warchal S;Qiu P;Molnar C;Vasilevich AS;Barry JD;Bansal HS;Kraus O;Wawer M;Paavolainen L;Herrmann MD;Rohban M;Hung J;Hennig H;Concannon J;Smith I;Clemons PA;Singh S;Rees P;Horvath P;Linington RG;Carpenter AE
通讯作者：
Carpenter AE
DOI：
10.1126/science.1198704
发表时间：
2011-05-06
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Bendall SC;Simonds EF;Qiu P;Amir el-AD;Krutzik PO;Finck R;Bruggner RV;Melamed R;Trejo A;Ornatsky OI;Balderas RS;Plevritis SK;Sachs K;Pe'er D;Tanner SD;Nolan GP
通讯作者：
Nolan GP