不同保存期单采血小板外泌体基因测序和蛋白组学的分析
不同保存期单采血小板外泌体基因测序和蛋白组学的分析
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DOI：
10.19746/j.cnki.issn1009-2137.2022
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发表时间：
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期刊：
影响因子：
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通讯作者：
汪德清
中科院分区：
文献类型：
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作者：
李小飞;张媛;蒲霏;宋英伟;汪德清
目的：明确不同保存期单采血小板（AP）外泌体基因测序和蛋白组学的差异变化，预测不同保存期 AP 外泌体的功能。方法：留取不同保存期 D0、D3 和 D5的单采血小板，用高速离心法提取外泌体，进行基因测序和蛋白组学分析，生物信息学分析并预测血小板外泌体的生物学功能。液相质谱分析技术检测外泌体蛋白的变化和功能预测；制备小RNA 测序文库，对构建好的文库进行测序和生物信息学技术数据分析。结果：AP 外泌体 iTRAQ 蛋白分析显示，与D0 相比，D3 储存的AP 外泌体有55 个上调蛋白和 94 个下调蛋白（P1.2），D5 储存的AP 外泌体有 292 个上调蛋白和 53 个下调蛋白（P1.2）。KEGG 通路分析结果表明，这些蛋白主要参与转运和代谢、免疫系统、癌症以及膜转运等过程。保存 D0、D3 和 D5 AP 释放的外泌体 miRNA 相比具有明显的统计学差异（P<0.01），其中D3 与D0 的外泌体miRNA 相比，上调 miRNA 数为374，下调 miRNA 数为 255；保存 D5 与D0 的外泌体 miRNA 相比，上调 miRNA 数为 297，下调 miRNA 数为 242；保存 D5 与D3 的外泌体 miRNA 相比，上调 miRNA 数为 252，下调 miRNA 数为327。对差异外泌体.miRNA的靶基因进行 GO 富集分析，差异 miRNA的靶基因主要参与膜的组成，发挥与蛋白结合的分子功能，并参与转录调.控的生物过程。结论：AP 保存末期与初期相比外泌体差异蛋白和差异 miRNA 显著变化，分别参与多种的生物过程。