New method for comparing DNA primary sequences based on a discrimination measure.
New method for comparing DNA primary sequences based on a discrimination measure.
复制标题
基于歧视度量的DNA主要序列进行比较的新方法。
DOI：
10.1016/j.jtbi.2010.07.040
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发表时间：
2010-10-21
影响因子：
2
通讯作者：
Zhao W
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Feng J;Hu Y;Wan P;Zhang A;Zhao W
我们介绍了一种新的方法来比较DNA一级序列。我们的方法的核心是一个新的衡量序列之间的成对距离。利用序列S和序列Q的本原判别子串，定义了判别测度DM（S，Q），用于序列S和序列Q的相似性分析。所提出的方法不需要多次对齐，是全自动的。为了说明其效用，我们构建系统发育树两个独立的数据集。实验结果表明，该方法是有效的.
We introduce a new approach to compare DNA primary sequences. The core of our method is a new measure of pairwise distances among sequences. Using the primitive discrimination substrings of sequence S and Q, a discrimination measure DM(S, Q) is defined for the similarity analysis of them. The proposed method does not require multiple alignments and is fully automatic. To illustrate its utility, we construct phylogenetic trees on two independent data sets. The results indicate that the method is efficient and powerful.
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影响因子：
3
作者：
Almeida JS;Vinga S
通讯作者：
Vinga S
DOI：
10.1073/pnas.83.14.5155
发表时间：
1986-07-01
影响因子：
11.1
作者：
BLAISDELL, BE
通讯作者：
BLAISDELL, BE
马尔可夫模型加上 k 字分布：产生用于序列比较的新颖统计测量的协同作用
影响因子：
5.8
作者：
Dai, Qi;Yang, Yanchun;Wang, Tianming
通讯作者：
Wang, Tianming
影响因子：
1
作者：
Almeida, Jonas S;Vinga, Susana
通讯作者：
Vinga, Susana
影响因子：
3.9
作者：
BLAISDELL, BE
通讯作者：
BLAISDELL, BE