JSONWP: a static website generator for protein bioinformatics research.
JSONWP: a static website generator for protein bioinformatics research.
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DOI：
10.1093/bioadv/vbad154
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发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
展示生物信息学研究的综合结果可能是具有挑战性的，需要复杂的可视化组件，这可能是耗时的开发。本文提出了一种有效沟通研究成果的新方法。我们开发了一个静态网页生成器JSONWP，它是专门为蛋白质生物信息学研究而设计的。利用REACT(一种用于构建Web应用程序的交互和动态用户界面的JavaScript库)，我们集成了公开可用的生物信息学可视化组件，以提供对这些组件的标准化访问。JSON(或JavaScript对象表示法，是一种轻量级文本数据格式，通常用于在不同软件工具之间组织和交换信息。)用作输入源，因为它能够使用键和值对表示几乎所有类型的数据。这允许研究人员使用他们喜欢的编程语言来创建JSON表示，然后可以通过JSONWP将其转换为网站。不需要服务器或域来托管网站，因为只需要可公开访问的JSON文件。总体而言，JSONWP为生物信息学研究人员有效地交流他们的发现提供了一个有用的新工具。开源实现位于https://github.com/MesihK/react-json-wpbuilder，，该工具可以在jsonwp.onrender.com上使用。
Presenting the integrated results of bioinformatics research can be challenging and requires sophisticated visualization components, which can be time-consuming to develop. This article presents a new way to effectively communicate research findings. We have developed a static web page generator, JSONWP, which is specifically designed for protein bioinformatics research. Utilizing React (a JavaScript library used to build interactive and dynamic user interfaces for web applications), we have integrated publicly available bioinformatics visualization components to provide standardized access to these components. JSON (or JavaScript Object Notation, is a lightweight textual data format often used to structure and exchange information between different software tools.) is used as the input source due to its ability to represent nearly all types of data using key and value pairs. This allows researchers to use their preferred programming language to create a JSON representation, which can then be converted into a website by JSONWP. No server or domain is required to host the website, as only the publicly accessible JSON file is required. Overall, JSONWP provides a useful new tool for bioinformatics researchers to effectively communicate their findings. The open-source implementation is located at https://github.com/MesihK/react-json-wpbuilder, and the tool can be used at jsonwp.onrender.com.
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影响因子：
5.8
作者：
Rose, Alexander S.;Bradley, Anthony R.;Rose, Peter W.
通讯作者：
Rose, Peter W.
影响因子：
3
作者：
Pettersen, EF;Goddard, TD;Ferrin, TE
通讯作者：
Ferrin, TE
DOI：
10.1073/pnas.2211823120
发表时间：
2023-02-28
影响因子：
11.1
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
2.9
作者：
Jia K;Jernigan RL
通讯作者：
Jernigan RL
影响因子：
14.9
作者：
Hoie, Magnus Haraldson;Kiehl, Erik Nicolas;Petersen, Bent;Nielsen, Morten;Winther, Ole;Nielsen, Henrik;Hallgren, Jeppe;Marcatili, Paolo
通讯作者：
Marcatili, Paolo