Increasing Capacity to Detect Clusters of Rapid HIV Transmission in Varied Populations-United States.
Increasing Capacity to Detect Clusters of Rapid HIV Transmission in Varied Populations-United States.
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DOI：
10.3390/v13040577
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发表时间：
2021-03-30
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
France AM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Oster AM;Panneer N;Lyss SB;McClung RP;Watson M;Saduvala N;Ocfemia MCB;Linley L;Switzer WM;Wertheim JO;Campbell E;Hernandez AL;France AM
分子簇检测分析艾滋病毒序列，以确定艾滋病毒的快速传播，并为公共卫生对策提供信息。我们描述的能力，以检测分子簇和地理变化的传播动力学的变化。我们检查了2015年12月至2019年12月国家艾滋病监测系统季度数据集中HIV-1聚合酶序列的报告完整性。每季度确定优先群组。为了了解最近受快速传播影响的人群，我们描述了2018-2019年首次发现的人群中的传播风险和种族/民族。2015年12月至2019年12月，国家序列完整性从26%增加到45%。在2018-2019年首次检测到的136个集群中的1212人中，69%是男男性行为者（MSM），11%是注射毒品者（PWID）。逐州分析显示，在快速传播集群中，传播风险和种族/族裔群体存在很大差异。艾滋病毒序列报告在全国范围内有所增加。分子聚类分析确定了不同人群中的快速传播，并确定了特定人群中快速传播的新模式，例如PWID，在2015-2016年，仅占此类分子聚类中的1%。这些数据可以指导为这些人群集中、定制和扩大预防和护理服务的努力。
Molecular cluster detection analyzes HIV sequences to identify rapid HIV transmission and inform public health responses. We describe changes in the capability to detect molecular clusters and in geographic variation in transmission dynamics. We examined the reporting completeness of HIV-1 polymerase sequences in quarterly National HIV Surveillance System datasets from December 2015 to December 2019. Priority clusters were identified quarterly. To understand populations recently affected by rapid transmission, we described the transmission risk and race/ethnicity of people in clusters first detected in 2018–2019. During December 2015 to December 2019, national sequence completeness increased from 26% to 45%. Of the 1212 people in the 136 clusters first detected in 2018–2019, 69% were men who have sex with men (MSM) and 11% were people who inject drugs (PWID). State-by-state analysis showed substantial variation in transmission risk and racial/ethnic groups in clusters of rapid transmission. HIV sequence reporting has increased nationwide. Molecular cluster analysis identifies rapid transmission in varied populations and identifies emerging patterns of rapid transmission in specific population groups, such as PWID, who, in 2015–2016, comprised only 1% of people in such molecular clusters. These data can guide efforts to focus, tailor, and scale up prevention and care services for these populations.
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影响因子：
33.9
作者：
Golden, Matthew R.;Lechtenberg, Richard;Buskin, Susan E.
通讯作者：
Buskin, Susan E.
DOI：
10.1097/qai.0000000000001856
发表时间：
2018-12-15
期刊：
Journal of acquired immune deficiency syndromes (1999)
影响因子：
--
作者：
Oster AM;France AM;Panneer N;Bañez Ocfemia MC;Campbell E;Dasgupta S;Switzer WM;Wertheim JO;Hernandez AL
通讯作者：
Hernandez AL
影响因子：
4.7
作者：
Erly, Steven J.;Herbeck, Joshua T.;Reuer, Jennifer R.
通讯作者：
Reuer, Jennifer R.
影响因子：
12.7
作者：
Alpren, Charles;Dawson, Erica L.;Buchacz, Kate
通讯作者：
Buchacz, Kate
影响因子：
1.5
作者：
Dasgupta, Sharoda;France, Anne Marie;Oster, Alexandra M.
通讯作者：
Oster, Alexandra M.