Population dynamics and drug resistance mutations in Plasmodium falciparum on the Bijagós Archipelago, Guinea-Bissau.
Population dynamics and drug resistance mutations in Plasmodium falciparum on the Bijagós Archipelago, Guinea-Bissau.
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DOI：
10.1038/s41598-023-33176-1
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发表时间：
2023-04-18
影响因子：
4.6
通讯作者：
Campino S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Moss S;Mańko E;Vasileva H;Da Silva ET;Goncalves A;Osborne A;Phelan J;Rodrigues A;Djata P;D'Alessandro U;Mabey D;Krishna S;Last A;Clark TG;Campino S
采取综合疟疾控制干预措施后，比热戈斯群岛的疟疾负担显着减轻。了解循环恶性疟原虫疟疾寄生虫的基因组多样性可以通过识别耐药突变和描述种群结构的复杂性来帮助控制感染。这项研究首次展示了来自比热戈斯群岛的恶性疟原虫分离株的全基因组序列数据。对取自 15 例无症状疟疾病例的干血斑样本的恶性疟原虫分离株的扩增 DNA 进行了测序。利用 795 个非洲恶性疟原虫分离株中的 130 万个 SNP，种群结构分析显示，来自群岛的分离株与来自西非大陆的样本聚类在一起，并且似乎与大陆种群密切相关；而不形成单独的系统发育簇。这项研究描述了与该群岛抗疟药物耐药性相关的单核苷酸多态性（SNP）。我们观察到与磺胺多辛-乙胺嘧啶耐药相关的 PfDHFR 突变 N51I 和 S108N 的固定，以及与氯喹耐药相关的 PfCRT K76T 的持续存在。这些数据与感染控制和耐药性监测相关；特别是考虑到根据世卫组织更新的建议，抗疟药物使用量预计会增加，以及该地区最近实施的季节性疟疾化学预防和大规模药物管理。
Following integrated malaria control interventions, malaria burden on the Bijagós Archipelago has significantly decreased. Understanding the genomic diversity of circulating Plasmodium falciparum malaria parasites can assist infection control, through identifying drug resistance mutations and characterising the complexity of population structure. This study presents the first whole genome sequence data for P. falciparum isolates from the Bijagós Archipelago. Amplified DNA from P. falciparum isolates sourced from dried blood spot samples of 15 asymptomatic malaria cases were sequenced. Using 1.3 million SNPs characterised across 795 African P. falciparum isolates, population structure analyses revealed that isolates from the archipelago cluster with samples from mainland West Africa and appear closely related to mainland populations; without forming a separate phylogenetic cluster. This study characterises SNPs associated with antimalarial drug resistance on the archipelago. We observed fixation of the PfDHFR mutations N51I and S108N, associated with resistance to sulphadoxine-pyrimethamine, and the continued presence of PfCRT K76T, associated with chloroquine resistance. These data have relevance for infection control and drug resistance surveillance; particularly considering expected increases in antimalarial drug use following updated WHO recommendations, and the recent implementation of seasonal malaria chemoprevention and mass drug administration in the region.
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临床免疫宿主是对药物敏感疟疾寄生虫的避难所。
影响因子：
3
作者：
Klein EY;Smith DL;Boni MF;Laxminarayan R
通讯作者：
Laxminarayan R
DOI：
10.1016/s1473-3099(21)00072-4
发表时间：
2021-11
期刊：
The Lancet. Infectious diseases
影响因子：
--
作者：
Andolina C;Rek JC;Briggs J;Okoth J;Musiime A;Ramjith J;Teyssier N;Conrad M;Nankabirwa JI;Lanke K;Rodriguez-Barraquer I;Meerstein-Kessel L;Arinaitwe E;Olwoch P;Rosenthal PJ;Kamya MR;Dorsey G;Greenhouse B;Drakeley C;Staedke SG;Bousema T
通讯作者：
Bousema T
与柬埔寨恶性疟原虫疟疾双氢青蒿素-哌喹失败相关的遗传标记：基因型-表型关联研究。
DOI：
10.1016/s1473-3099(16)30409-1
发表时间：
2017-03
期刊：
The Lancet. Infectious diseases
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--
作者：
Amato R;Lim P;Miotto O;Amaratunga C;Dek D;Pearson RD;Almagro-Garcia J;Neal AT;Sreng S;Suon S;Drury E;Jyothi D;Stalker J;Kwiatkowski DP;Fairhurst RM
通讯作者：
Fairhurst RM
影响因子：
3
作者：
Nsanzabana C;Djalle D;Guérin PJ;Ménard D;González IJ
通讯作者：
González IJ
影响因子：
1.2
作者：
Cingolani, Pablo;Platts, Adrian;Ruden, Douglas M.
通讯作者：
Ruden, Douglas M.