Structure Basis for Shaping the Nse4 Protein by the Nse1 and Nse3 Dimer within the Smc5/6 Complex.
Structure Basis for Shaping the Nse4 Protein by the Nse1 and Nse3 Dimer within the Smc5/6 Complex.
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DOI：
10.1016/j.jmb.2021.166910
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发表时间：
2021-04-30
影响因子：
5.6
通讯作者：
Cho Y
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Jo A;Li S;Shin JW;Zhao X;Cho Y
Smc 5/6复合物促进染色体复制和DNA断裂修复。在该复合物中，由Nse 1、Nse 3和Nse 4组成的亚复合物被认为通过DNA结合和调节复合物的ATP依赖性活性而发挥多种作用。然而，Nse 1-Nse 3-Nse 4亚复合物如何执行这些多重功能仍不清楚。为了解决这个问题，我们确定了非洲爪蟾Nse 1-Nse 3-Nse 4亚复合物的晶体结构，分辨率为1.7 μ m，并研究了它如何与DNA相互作用。我们的结构分析表明，Nse 1-Nse 3二聚体采用封闭的构象，并与Nse 4的一段形成三个界面，迫使它进入Z形构象。Nse 1-Nse 3-Nse 4结构为肺部疾病免疫缺陷和染色体断裂综合征引起的突变如何从Nse 1-Nse 3中驱逐Nse 4提供了解释。我们的DNA结合和突变分析表明，Nse 4的N-末端和中间区域有助于DNA相互作用和细胞活力。将我们的数据与以前的交联质谱数据相结合，我们提出了Nse 1-Nse 3-Nse 4复合物在Smc 5/6复合物中结合DNA的潜在作用。
The Smc5/6 complex facilitates chromosome replication and DNA break repair. Within this complex, a subcomplex composed of Nse1, Nse3 and Nse4 is thought to play multiple roles through DNA binding and regulating ATP-dependent activities of the complex. However, how the Nse1-Nse3-Nse4 subcomplex carries out these multiple functions remain unclear. To address this question, we determine the crystal structure of the Xenopus laevis Nse1-Nse3-Nse4 subcomplex at 1.7 Å resolution and examine how it interacts with DNA. Our structural analyses show that the Nse1-Nse3 dimer adopts a closed conformation and forms three interfaces with a segment of Nse4, forcing it into a Z-shaped conformation. The Nse1-Nse3-Nse4 structure provides an explanation for how the lung disease immunodeficiency and chromosome breakage syndrome-causing mutations could dislodge Nse4 from Nse1-Nse3. Our DNA binding and mutational analyses reveal that the N-terminal and the middle region of Nse4 contribute to DNA interaction and cell viability. Integrating our data with previous crosslink mass spectrometry data, we propose potential roles of the Nse1-Nse3-Nse4 complex in binding DNA within the Smc5/6 complex.
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DOI：
10.1126/science.aar7831
发表时间：
2018-04-06
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Ganji M;Shaltiel IA;Bisht S;Kim E;Kalichava A;Haering CH;Dekker C
通讯作者：
Dekker C
影响因子：
3.7
作者：
Hudson JJ;Bednarova K;Kozakova L;Liao C;Guerineau M;Colnaghi R;Vidot S;Marek J;Bathula SR;Lehmann AR;Palecek J
通讯作者：
Palecek J
影响因子：
14.8
作者：
Kelley LA;Mezulis S;Yates CM;Wass MN;Sternberg MJ
通讯作者：
Sternberg MJ
影响因子：
3.7
作者：
Guerineau M;Kriz Z;Kozakova L;Bednarova K;Janos P;Palecek J
通讯作者：
Palecek J
DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K