Alternative splicing of the Caenorhabditis elegans lev-11 tropomyosin gene is regulated in a tissue-specific manner.
Alternative splicing of the Caenorhabditis elegans lev-11 tropomyosin gene is regulated in a tissue-specific manner.
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DOI：
10.1002/cm.21489
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发表时间：
2018-10
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Kuroyanagi H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Watabe E;Ono S;Kuroyanagi H
原肌球蛋白亚型有助于产生功能不同的肌动蛋白丝。在线虫秀丽隐杆线虫中，通过两个独立的启动子和选择性前mRNA剪接的组合，从单个原肌球蛋白基因lev-11产生多种亚型。在这项研究中，我们报告说，lev-11的选择性剪接的组织特异性的方式进行调节，使一个特定的原肌球蛋白亚型在每个组织中表达。逆转录聚合酶链反应分析lev-11 mRNAs证实了5个先前报道的亚型（LEV-11 A，LEV-11 C，LEV-11 D，LEV-11 E和LEV-11 O），并确定了一个新的第六亚型LEV-11 T。使用转基因选择性剪接报告小基因，我们发现在咽，体壁肌肉，肠道和神经元的优先外显子选择不同的模式。体壁肌肉优先加工剪接以产生高分子量的亚型，LEV-11 A，LEV-11 D和LEV-11 O。咽特异性地处理剪接以表达低分子量亚型LEV-11 E，而肠和神经元处理剪接以表达另一种低分子量亚型LEV-11 C。LEV-11 T的剪接模式在这些组织中均不占主导地位，表明这是一种次要亚型。我们的研究结果表明，选择性剪接的调节是一个重要的机制，表达适当的原肌球蛋白异构体在特定的组织和/或细胞类型在C。优雅
Tropomyosin isoforms contribute to generation of functionally divergent actin filaments. In the nematode Caenorhabditis elegans, multiple isoforms are produced from lev-11, the single tropomyosin gene, by combination of two separate promoters and alternative pre-mRNA splicing. In this study, we report that alternative splicing of lev-11 is regulated in a tissue-specific manner so that a particular tropomyosin isoform is expressed in each tissue. Reverse-transcription polymerase chain reaction analysis of lev-11 mRNAs confirms five previously reported isoforms (LEV-11A, LEV-11C, LEV-11D, LEV-11E, and LEV-11O) and identifies a new sixth isoform LEV-11T. Using transgenic alternative-splicing reporter minigenes, we find distinct patterns of preferential exon selections in the pharynx, body wall muscles, intestine, and neurons. The body wall muscles preferentially process splicing to produce high-molecular-weight isoforms, LEV-11A, LEV-11D, and LEV-11O. The pharynx specifically processes splicing to express a low-molecular-weight isoform LEV-11E, whereas the intestine and neurons process splicing to express another low-molecular-weight isoform LEV-11C. The splicing pattern of LEV-11T was not predominant in any of these tissues, suggesting that this is a minor isoform. Our results suggest that regulation of alternative splicing is an important mechanism to express proper tropomyosin isoforms in particular tissue and/or cell types in C. elegans.
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影响因子：
3.3
作者：
Barnes DE;Watabe E;Ono K;Kwak E;Kuroyanagi H;Ono S
通讯作者：
Ono S
DOI：
10.1016/j.bbapap.2007.01.003
发表时间：
2007-04-01
影响因子：
3.2
作者：
Amin, Md. Ziaul;Bando, Tetsuya;Kagawa, Hiroaki
通讯作者：
Kagawa, Hiroaki
影响因子：
5.6
作者：
Anyanful, A;Sakube, Y;Kagawa, H
通讯作者：
Kagawa, H
影响因子：
4
作者：
Gunning, Peter W.;Hardeman, Edna C.;Mulvihill, Daniel P.
通讯作者：
Mulvihill, Daniel P.
影响因子：
56.9
作者：
Cao, Junyue;Packer, Jonathan S.;Shendure, Jay
通讯作者：
Shendure, Jay