HemI: a toolkit for illustrating heatmaps.
HemI: a toolkit for illustrating heatmaps.
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HemI：用于说明热图的工具包
DOI：
10.1371/journal.pone.0111988
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发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Xue Y
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Deng W;Wang Y;Liu Z;Cheng H;Xue Y
最近的高通量技术在各个方面产生了大量的生物数据。在单个热图中对多维和数字基因或蛋白质表达数据进行转换和可视化可以提供不同条件下分子动力学的简洁而全面的呈现。在这项工作中，我们开发了一个名为 HemI（热图 Illustrator）的易于使用的工具，它可以在热图中可视化基因或蛋白质表达数据。此外，热图可以以定制的方式重新着色、重新缩放或旋转。此外，HemI 还提供了多种聚类策略来分析数据。出版物质量的数据可以直接导出。我们认为 HemI 可以成为一个有用的工具包，可以方便地可视化和操作热图。 HemI 的独立包是用 Java 实现的，可以通过 http://hemi.biocuckoo.org/down.php 访问。
Recent high-throughput techniques have generated a flood of biological data in all aspects. The transformation and visualization of multi-dimensional and numerical gene or protein expression data in a single heatmap can provide a concise but comprehensive presentation of molecular dynamics under different conditions. In this work, we developed an easy-to-use tool named HemI (Heat map Illustrator), which can visualize either gene or protein expression data in heatmaps. Additionally, the heatmaps can be recolored, rescaled or rotated in a customized manner. In addition, HemI provides multiple clustering strategies for analyzing the data. Publication-quality figures can be exported directly. We propose that HemI can be a useful toolkit for conveniently visualizing and manipulating heatmaps. The stand-alone packages of HemI were implemented in Java and can be accessed at http://hemi.biocuckoo.org/down.php.
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影响因子：
9.5
作者：
Pabinger S;Dander A;Fischer M;Snajder R;Sperk M;Efremova M;Krabichler B;Speicher MR;Zschocke J;Trajanoski Z
通讯作者：
Trajanoski Z
影响因子：
46.9
作者：
Wahlberg, Elisabet;Karlberg, Tobias;Weigelt, Johan
通讯作者：
Weigelt, Johan
DOI：
10.1093/bioinformatics/btu094
发表时间：
2014-06-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Deu-Pons, Jordi;Schroeder, Michael P;Lopez-Bigas, Nuria
通讯作者：
Lopez-Bigas, Nuria
影响因子：
5.8
作者：
Seo, J;Gordish-Dressman, H;Hoffman, EP
通讯作者：
Hoffman, EP
影响因子：
3
作者：
Battke F;Symons S;Nieselt K
通讯作者：
Nieselt K