CryptoDB: a Cryptosporidium bioinformatics resource update.

CryptoDB: a Cryptosporidium bioinformatics resource update.
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CryptoDB:加密孢子生物信息学资源更新。

DOI:
10.1093/nar/gkj078
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发表时间:
2006-01-01
影响因子:
14.9
通讯作者:
Kissinger JC
Kissinger JC
中科院分区:
生物学2区
文献类型:
--
作者:
Heiges M;Wang H;Robinson E;Aurrecoechea C;Gao X;Kaluskar N;Rhodes P;Wang S;He CZ;Su Y;Miller J;Kraemer E;Kissinger JC

文献摘要

参考文献

被引文献

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数据库CryptoDB()是艾滋病相关顶端复合体寄生虫隐孢子虫的社区生物信息学资源。CryptoDB将全基因组序列和注释与表达序列标签和基因组调查序列数据集成在一起,并提供补充的生物信息学分析和数据挖掘工具。一个简单而全面的Web界面可用于挖掘和可视化数据。CryptoDB通过ApiDB与数据库PlamoDB和ToxoDB结盟,ApiDB是NIH/NIAID资助的生物信息学资源中心。最近对CryptoDB的更新包括储存微小隐孢子虫和人隐孢子虫的注释基因组序列,迁移到关系数据库(GUS),一个新的查询和可视化界面,以及引入Web服务。
The database, CryptoDB (), is a community bioinformatics resource for the AIDS-related apicomplexan-parasite, Cryptosporidium. CryptoDB integrates whole genome sequence and annotation with expressed sequence tag and genome survey sequence data and provides supplemental bioinformatics analyses and data-mining tools. A simple, yet comprehensive web interface is available for mining and visualizing the data. CryptoDB is allied with the databases PlasmoDB and ToxoDB via ApiDB, an NIH/NIAID-fundedBioinformatics Resource Center. Recent updates to CryptoDB include the deposition of annotated genome sequences for Cryptosporidium parvum and Cryptosporidium hominis, migration to a relational database (GUS), a new query and visualization interface and the introduction of Web services.
DOI: 10.1101/gr.1555203
发表时间: 2003-08-01
期刊: GENOME RESEARCH
影响因子: 7
作者:
Bankier, AT;Spriggs, HF;Dear, PH
通讯作者: Dear, PH
DOI: 10.1093/nar/gkh112
发表时间: 2004-01-01
影响因子: 14.9
作者:
Li, L;Crabtree, J;Roos, DS
通讯作者: Roos, DS
DOI: 10.1093/nar/gkg072
发表时间: 2003-01-01
影响因子: 14.9
作者:
Kissinger, JC;Gajria, B;Roos, DS
通讯作者: Roos, DS
DOI: 10.1147/sj.402.0512
发表时间: 2001-01-01
影响因子: --
作者:
Davidson, SB;Crabtree, J;Stoeckert, CJ
通讯作者: Stoeckert, CJ
DOI: 10.1101/gr.403602
发表时间: 2002-10-01
期刊: GENOME RESEARCH
影响因子: 7
作者:
Stein, LD;Mungall, C;Lewis, S
通讯作者: Lewis, S