C-BERST: defining subnuclear proteomic landscapes at genomic elements with dCas9-APEX2.
C-BERST: defining subnuclear proteomic landscapes at genomic elements with dCas9-APEX2.
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DOI：
10.1038/s41592-018-0006-2
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发表时间：
2018-06
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Sontheimer EJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gao XD;Tu LC;Mir A;Rodriguez T;Ding Y;Leszyk J;Dekker J;Shaffer SA;Zhu LJ;Wolfe SA;Sontheimer EJ
在活细胞中定位不同基因组位置的蛋白质组分一直是一个长期的挑战。在这里，我们报告了通过限制性空间标签在基因组元件上的dCas9-APEX2生物素化(C-BERST)允许蛋白质组在定义的基因组座位附近快速、无偏地定位，就像端粒和着丝粒一样。C-BERST能够高通量鉴定与特定序列相关的蛋白质，便于注释这些因子及其在核生物学中的作用。
Mapping proteomic composition at distinct genomic loci in living cells has been a long-standing challenge. Here we report that dCas9-APEX2 Biotinylation at genomic Elements by Restricted Spatial Tagging (C-BERST) allows the rapid, unbiased mapping of proteomes near defined genomic loci, as demonstrated for telomeres and centromeres. C-BERST enables the high-throughput identification of proteins associated with specific sequences, facilitating annotation of these factors and their roles in nuclear biology.
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影响因子：
8.8
作者：
Garcia-Exposito L;Bournique E;Bergoglio V;Bose A;Barroso-Gonzalez J;Zhang S;Roncaioli JL;Lee M;Wallace CT;Watkins SC;Opresko PL;Hoffmann JS;O'Sullivan RJ
通讯作者：
O'Sullivan RJ
DOI：
10.1083/jcb.201604115
发表时间：
2016-08-29
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Ma H;Tu LC;Naseri A;Huisman M;Zhang S;Grunwald D;Pederson T
通讯作者：
Pederson T
DOI：
10.1126/science.aan6490
发表时间：
2018-01-05
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Kabeche L;Nguyen HD;Buisson R;Zou L
通讯作者：
Zou L
DOI：
10.1083/jcb.201112098
发表时间：
2012-03-19
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Roux KJ;Kim DI;Raida M;Burke B
通讯作者：
Burke B
DOI：
10.1038/nrm3107
发表时间：
2011-05
期刊：
Nature reviews. Molecular cell biology
影响因子：
--
作者：
通讯作者：
--