三种锦鸡儿属植物过氧化氢酶基因的克隆及表达特性分析

三种锦鸡儿属植物过氧化氢酶基因的克隆及表达特性分析
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DOI:
10.13417/j.gab.039.001498
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发表时间:
2020
期刊:
基因组学与应用生物学
影响因子:
--
通讯作者:
林晓飞
林晓飞
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者:
张喆;李宁宁;贾翠翠;高丽;王丽;林晓飞

文献摘要

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为研究过氧化氢酶基因在锦鸡儿属植物抵御干旱胁迫中发挥的作用,采用兼并PCR (degenerate polymerase chain reaction,Deg-PCR)和末端克隆(rapid amplify cDNA ends,RACE)技术分离了柠条锦鸡儿(Caragana korshinskiikom)、小叶锦鸡儿(C.microphylla)和中间锦鸡儿(C.davazamcii)的过氧化氢酶(Catalase,CAT)基因cDNA序列,并对它们在干旱胁迫条件下的表达特性进行了比较分析。这3种锦鸡儿属植物CAT cDNA均为1755bp,含有1个1479bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)、85个碱基的5' 非编码区和201个碱基的3' 非编码区,编码492个氨基酸的蛋白质。序列比较分析发现,该3条序列仅在322bp处有一个碱基的差异(CkCAT为T碱基,CmCAT和CdCAT为C碱基),但它们编码相同的氨基酸。生物信息学分析显示,CkCAT、CmCAT和CiCAT的与其他植物的CAT蛋白具有较高的同源性,在进化上与豇豆和大豆的CAT亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析结果显示,在干旱胁迫条件下CkCAT、CmCAT和CdCAT的表达量明显升高,显示CAT在锦鸡儿属植物抵御干旱逆境中发挥重要作用。