A new model for the estimation of cell proliferation dynamics using CFSE data.
A new model for the estimation of cell proliferation dynamics using CFSE data.
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DOI：
10.1016/j.jim.2011.08.014
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发表时间：
2011-10-28
影响因子：
2.2
通讯作者：
Meyerhans, Andreas
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Banks, H. T.;Sutton, Karyn L.;Thompson, W. Clayton;Bocharov, Gennady;Doumic, Marie;Schenkel, Tim;Argilaguet, Jordi;Giest, Sandra;Peligero, Cristina;Meyerhans, Andreas
关键词：
增殖细胞群的CFSE分析是研究细胞分裂和细胞行为中与分裂相关的变化的常用工具。最近，一个偏微分方程（PDE）模型来描述CFSE增殖试验中的淋巴细胞动力学被提出。我们提出了一个显着的修订，这提高了几个参数的生理理解这个模型。也就是说，先前用作通过细胞分裂稀释CFSE染料的启发式解释的参数γ被替换为更物理的组分，细胞自体荧光。还使用Gompertz衰变过程定量标记衰变的速率。然后，我们展示了一个修改后的方法拟合模型的常用直方图表示的数据。结果表明，这些改进导致一个模型具有强大的生理基础，这是完全能够复制的数据中观察到的行为。
CFSE analysis of a proliferating cell population is a popular tool for the study of cell division and division-linked changes in cell behavior. Recently, a partial differential equation (PDE) model to describe lymphocyte dynamics in a CFSE proliferation assay was proposed. We present a significant revision of this model which improves the physiological understanding of several parameters. Namely, the parameter γ used previously as a heuristic explanation for the dilution of CFSE dye by cell division is replaced with a more physical component, cellular autofluorescence. The rate at which label decays is also quantified using a Gompertz decay process. We then demonstrate a revised method of fitting the model to the commonly used histogram representation of the data. It is shown that these improvements result in a model with a strong physiological basis which is fully capable of replicating the behavior observed in the data.
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