Modeling spatiotemporal dynamics of bacterial populations.
Modeling spatiotemporal dynamics of bacterial populations.
复制标题
模拟细菌种群的时空动态。
DOI：
10.1007/978-1-61779-833-7_11
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发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
You,Lingchong
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Song,Hao;You,Lingchong
细胞时空动力学的定量建模有助于对生物系统的理解和工程设计。以一个人工合成的细菌生态系统为工作台，提出了一种对该生态系统的时空种群动态进行数学模拟的方法。首先对生态系统的遗传结构和模型发展进行了描述。然后给出了所导出的偏微分方程组的参数估计和计算方法。通过数值求解PDE模型来计算时空方向图的形成。根据细胞的分布模式，计算了生态系统的生物多样性以及细胞播种距离和移动性对生物多样性的影响。
Quantitative modeling of spatiotemporal dynamics of cells facilitates understanding and engineering of biological systems. Using a synthetic bacterial ecosystem as a workbench, we present the approach to mathematically simulate the spatiotemporal population dynamics of the ecosystem. A description of ecosystem’s genetic construction and model development is firstly given. Parameter estimation and computational approach for the derived partial differential equations (PDEs) are then given. Spatiotemporal pattern formation is computed by numerically solving the PDE model. Biodiversity of the ecosystem and its impacts by cellular seeding distance and motility are computed according to the cell distribution patterns.
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DOI：
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发表时间：
2008-01-01
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