SoyBase, the USDA-ARS soybean genetics and genomics database.
SoyBase, the USDA-ARS soybean genetics and genomics database.
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DOI：
10.1093/nar/gkp798
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发表时间：
2010-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Shoemaker RC
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Grant D;Nelson RT;Cannon SB;Shoemaker RC
SoyBase是USDA-ARS大豆遗传数据库，是专业策划的大豆遗传学、基因组学和相关数据资源的综合储存库。SoyBase包含最新的遗传、物理和基因组序列图，集成了质量和数量性状。数量性状基因座(QTL)代表了超过18年的90多个独特性状的QTL定位。SoyBase还包含注释良好的‘Williams 82’基因组序列和相关的数据挖掘工具。大豆染色体的遗传和序列观点与大量的性状和表型数据是广泛关联的。这允许使用几乎任何类型的可用信息进入数据库，例如遗传图谱符号、大豆基因名称或表型性状。SoyBase是大豆生长、发育和性状词汇的受控词汇库，这些词汇也与更一般的植物本体论相联系。可以通过http://soybase.org.访问SoyBase。
SoyBase, the USDA-ARS soybean genetic database, is a comprehensive repository for professionally curated genetics, genomics and related data resources for soybean. SoyBase contains the most current genetic, physical and genomic sequence maps integrated with qualitative and quantitative traits. The quantitative trait loci (QTL) represent more than 18 years of QTL mapping of more than 90 unique traits. SoyBase also contains the well-annotated ‘Williams 82’ genomic sequence and associated data mining tools. The genetic and sequence views of the soybean chromosomes and the extensive data on traits and phenotypes are extensively interlinked. This allows entry to the database using almost any kind of available information, such as genetic map symbols, soybean gene names or phenotypic traits. SoyBase is the repository for controlled vocabularies for soybean growth, development and trait terms, which are also linked to the more general plant ontologies. SoyBase can be accessed at http://soybase.org.
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Stein, LD;Mungall, C;Lewis, S
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