A magnesium ion core at the heart of a ribozyme domain
A magnesium ion core at the heart of a ribozyme domain
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DOI：
10.1038/nsb0797-553
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发表时间：
1997-07-01
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
Doudna, JA
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Cate, JH;Hanna, RL;Doudna, JA
大的核酶需要二价金属离子来折叠。我们在这里表明，四膜虫组I内含子P4-P6域的三级结构成核周围的镁离子核心。在域晶体结构中，五个镁离子结合在分子中心的三螺旋结中。在这个三螺旋连接中的四个镁位点中的任何一个中的单个原子变化破坏整个160个核苷酸的P4-P6结构域的折叠。镁离子核可以是蛋白质疏水核的RNA对应物，将RNA分子的一部分掩埋在天然结构中。
Large ribozymes require divalent metal ions to fold. We show here that the tertiary structure of the Tetrahymena group I intron P4-P6 domain nucleates around a magnesium ion core. In the domain crystal structure, five magnesium ions bind in a three-helix junction at the centre of the molecule. Single atom changes in any one of four magnesium sites in this three-helix junction destroy folding of the entire 160-nucleotide P4-P6 domain. The magnesium ion core may be the RNA counterpart to the protein hydrophobic core, burying parts of the RNA molecule in the native structure.