Speeding up Inference of Homologous Recombination in Bacteria

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加速细菌同源重组的推断

DOI:
10.1101/2020.05.10.087007
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发表时间:
2020
期刊:
--
影响因子:
--
通讯作者:
Medina-Aguayo F
Medina-Aguayo F
中科院分区:
--
文献类型:
--
作者:
Medina-Aguayo F

文献摘要

参考文献

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关于Priors的详细信息:完整参数集使用的先验分布的详细信息。似然计算:详细介绍如何使用JC 69模型计算似然函数。RJMCMC作为MCMC中的重要性估计量:简要说明RJMCMC中的接受率如何被理解为理想算法中比率的无偏估计量。退火移动:主要算法中使用的向上和向下移动的详细信息。
Details on priors: Full details of prior distributions used on the full set of parameters.Likelihood computation: Details on how to compute the likelihood function using the JC69 model.RJMCMC as an importance estimator within MCMC: Brief explanation of how the acceptance ratio in the RJMCMC can be understood as an unbiased estimator of the ratio in the ideal algorithm.Annealing Moves: Details of the upwards and downwards moves used in the main algorithm.
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