TGF-β-associated extracellular matrix genes link cancer-associated fibroblasts to immune evasion and immunotherapy failure.
TGF-β-associated extracellular matrix genes link cancer-associated fibroblasts to immune evasion and immunotherapy failure.
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DOI：
10.1038/s41467-018-06654-8
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发表时间：
2018-11-08
影响因子：
16.6
通讯作者：
De Carvalho DD
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chakravarthy A;Khan L;Bensler NP;Bose P;De Carvalho DD
细胞外基质（ECM）是癌症进展和预后的关键决定因素。在此，我们报告了癌症中 ECM 基因失调的最大泛癌分析之一的结果。我们定义了一组在癌症中上调的独特 ECM 基因 (C-ECM)，并与较差的预后相关。我们发现 C-ECM 转录程序失调与癌症相关成纤维细胞中 TGF-β 信号传导的激活相关，并与其他免疫活性肿瘤中的免疫抑制有关。激活该程序的癌症携带不同的基因组图谱，例如 BRAF、SMAD4 和 TP53 突变以及 MYC 扩增。最后，我们证明该特征是 PD-1 阻断失败的预测因子，并且优于之前提出的生物标志物。因此，我们的研究结果确定了跨癌症运行中 ECM 基因的独特转录模式，这些基因可能是潜在的目标，有待临床前验证，使用 TGF-β 阻断来增强对免疫检查点阻断的反应。 ECM 的变化对胰腺癌和结直肠癌的预后具有预测价值。在这里，作者进行了泛癌分析，发现了与 TGF-β 信号传导特征相关并与免疫治疗失败相关的 ECM 基因子集。
The extracellular matrix (ECM) is a key determinant of cancer progression and prognosis. Here we report findings from one of the largest pan-cancer analyses of ECM gene dysregulation in cancer. We define a distinct set of ECM genes upregulated in cancer (C-ECM) and linked to worse prognosis. We found that the C-ECM transcriptional programme dysregulation is correlated with the activation of TGF-β signalling in cancer-associated fibroblasts and is linked to immunosuppression in otherwise immunologically active tumours. Cancers that activate this programme carry distinct genomic profiles, such as BRAF, SMAD4 and TP53 mutations and MYC amplification. Finally, we show that this signature is a predictor of the failure of PD-1 blockade and outperforms previously-proposed biomarkers. Thus, our findings identify a distinct transcriptional pattern of ECM genes in operation across cancers that may be potentially targeted, pending preclinical validation, using TGF-β blockade to enhance responses to immune-checkpoint blockade. Changes in ECM are of predictive value in pancreatic and colorectal cancer prognosis. Here, the authors perform a pan-cancer analysis and find a subset of ECM genes that is linked to TGF-β signalling signature and is correlated with immunotherapy failure.
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影响因子：
50.3
作者：
Özdemir BC;Pentcheva-Hoang T;Carstens JL;Zheng X;Wu CC;Simpson TR;Laklai H;Sugimoto H;Kahlert C;Novitskiy SV;De Jesus-Acosta A;Sharma P;Heidari P;Mahmood U;Chin L;Moses HL;Weaver VM;Maitra A;Allison JP;LeBleu VS;Kalluri R
通讯作者：
Kalluri R
影响因子：
16.6
作者：
Cortes-Ciriano I;Lee S;Park WY;Kim TM;Park PJ
通讯作者：
Park PJ
DOI：
10.1074/mcp.m111.014647
发表时间：
2012-04
期刊：
Molecular & cellular proteomics : MCP
影响因子：
--
作者：
Naba A;Clauser KR;Hoersch S;Liu H;Carr SA;Hynes RO
通讯作者：
Hynes RO
影响因子：
64.5
作者：
Hugo W;Zaretsky JM;Sun L;Song C;Moreno BH;Hu-Lieskovan S;Berent-Maoz B;Pang J;Chmielowski B;Cherry G;Seja E;Lomeli S;Kong X;Kelley MC;Sosman JA;Johnson DB;Ribas A;Lo RS
通讯作者：
Lo RS
影响因子：
5.6
作者：
Caja L;Dituri F;Mancarella S;Caballero-Diaz D;Moustakas A;Giannelli G;Fabregat I
通讯作者：
Fabregat I