Biological Web Services: Integration, Optimization, and Reasoning
Biological Web Services: Integration, Optimization, and Reasoning
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生物 Web 服务：集成、优化和推理
DOI：
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发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
Efthymia Tsamoura
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Michael Benedikt;Rodrigo Lopez;Efthymia Tsamoura
大量的生物数据现在可以通过网络服务获得。然而，这些数据的有用性受到执行需要跨多个服务的数据的查询的困难的限制。我们概述了一个平台，它提供了集成的数据访问与最小的用户意识。用户提出高层次的查询，这个平台，系统应用推理技术和基于成本的优化的组合，以产生一个高效和可靠的实现上的服务。我们简要地解释了平台的推理范式，这是基于精确的重新制定，然后我们概述了平台的使用上的一组生物信息学来源，并提供了一些初步的结果，其性能。
A vast amount of biological data is now available via web services. Yet the usefulness of this data is limited by the difficulty in performing queries that require data spanning multiple services. We overview a platform which offers integrated data access with minimal user awareness. Users pose high-level queries to this platform, and the system applies a combination of reasoning techniques and cost-based optimization to generate an efficient and reliable implementation on top of the services. We briefly explain the platform’s reasoning paradigm, which is based on exact reformulation; we then overview the platform’s use on a set of bioinformatics sources, and provide some preliminary results concerning its performance.