New Gromov-Inspired Metrics on Phylogenetic Tree Space
New Gromov-Inspired Metrics on Phylogenetic Tree Space
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受格罗莫夫启发的系统发育树空间新度量
DOI：
10.1007/s11538-017-0385-z
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发表时间：
2018
影响因子：
3.5
通讯作者：
V. Liebscher
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
V. Liebscher
我们提出了一类新的度量无根系统发育X-树的启发（紧凑）度量空间的Gromov-Hausdorff距离。这些度量可以通过线性或二次规划来有效地计算。他们在NNI操作下也很强大。度量的本地行为表明，它们不同于任何先前引入的度量。随机加权和未加权树以及随机毛虫的性能的指标进行了简要分析。
We present a new class of metrics for unrooted phylogenetic X-trees inspired by the Gromov–Hausdorff distance for (compact) metric spaces. These metrics can be efficiently computed by linear or quadratic programming. They are robust under NNI operations, too. The local behaviour of the metrics shows that they are different from any previously introduced metrics. The performance of the metrics is briefly analysed on random weighted and unweighted trees as well as random caterpillars.
L-Infinity 优化对 Bergman 拟阵粉丝的影响及其在系统发育学中的应用
影响因子：
0.8
作者：
Bernstein, Daniel Irving
通讯作者：
Bernstein, Daniel Irving
关于路径间隔距离的注释。
影响因子：
2
作者：
Coons,JaneIvy;Rusinko,Joseph
通讯作者：
Rusinko,Joseph