The folding of the specific DNA recognition subdomain of the sleeping beauty transposase is temperature-dependent and is required for its binding to the transposon DNA.
The folding of the specific DNA recognition subdomain of the sleeping beauty transposase is temperature-dependent and is required for its binding to the transposon DNA.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0112114
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发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Nesmelova IV
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Leighton GO;Konnova TA;Idiyatullin B;Hurr SH;Zuev YF;Nesmelova IV
当转座酶与转座子 DNA 结合时，DNA 转座反应开始。睡美人是 DNA 转座子水手家族的一员。尽管它是遗传应用中的重要工具并且已适用于人类基因治疗，但其分子机制仍然不清楚。在这里，我们证明只有睡美人转座酶的特定 DNA 识别子域（PAI 子域）的折叠构象才能与转座子 DNA 结合。此外，我们发现 PAI 亚结构域在低温下折叠良好，但在温度高于 15°C 时，未折叠构象的存在逐渐增加，这表明温度的选择对于最佳转座酶活性可能很重要。总体而言，这些结果为睡美人转座酶的 DNA 识别提供了分子水平的见解。
The reaction of DNA transposition begins when the transposase enzyme binds to the transposon DNA. Sleeping Beauty is a member of the mariner family of DNA transposons. Although it is an important tool in genetic applications and has been adapted for human gene therapy, its molecular mechanism remains obscure. Here, we show that only the folded conformation of the specific DNA recognition subdomain of the Sleeping Beauty transposase, the PAI subdomain, binds to the transposon DNA. Furthermore, we show that the PAI subdomain is well folded at low temperatures, but the presence of unfolded conformation gradually increases at temperatures above 15°C, suggesting that the choice of temperature may be important for the optimal transposase activity. Overall, the results provide a molecular-level insight into the DNA recognition by the Sleeping Beauty transposase.
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DOI：
10.1016/j.trsl.2012.12.005
发表时间：
2013-04
期刊：
Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
影响因子：
--
作者：
Hackett PB;Largaespada DA;Switzer KC;Cooper LJ
通讯作者：
Cooper LJ
影响因子：
1.5
作者：
Bouuaert, Corentin Claeys;Chalmers, Ronald M.
通讯作者：
Chalmers, Ronald M.
影响因子：
3.6
作者：
Haren, L;Betermier, M;Chandler, M
通讯作者：
Chandler, M
影响因子：
2.9
作者：
Ilyina, E;Roongta, V;Mayo, KH
通讯作者：
Mayo, KH
影响因子：
3.2
作者：
KRETSCHMER, PJ;COHEN, SN
通讯作者：
COHEN, SN