Structural basis for translation termination by archaeal RF1 and GTP-bound EF1α complex.
Structural basis for translation termination by archaeal RF1 and GTP-bound EF1α complex.
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DOI：
10.1093/nar/gks660
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发表时间：
2012-10
影响因子：
14.9
通讯作者：
Nureki O
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kobayashi K;Saito K;Ishitani R;Ito K;Nureki O
当终止密码子出现在核糖体A位点时，I类和II类释放因子（RF）终止翻译。在真核生物和古细菌中，I类和II类RF形成异二聚体复合物，并以GTP依赖的方式完成整个翻译终止过程。然而，I类和II类RF复合物的翻译终止的结构机制仍然没有得到解决。在古细菌中，古细菌延伸因子1 α（aEF 1 α）是tRNA的载体，通过与古细菌RF 1（aRF 1）形成异二聚体复合物而作为II类RF。我们报道了第一个活性I类和II类RF复合物aRF 1·aEF 1 α复合物的晶体结构。这种结构非常类似于tRNA·EF-Tu复合物，表明aRF 1通过模拟tRNA有效地传递到核糖体A位点。它提供了深入了解耦合GTP水解II类RF终止密码子识别和肽基-tRNA水解I类RF的机制。我们讨论了aEF 1 α识别aRF 1和aPelota（另一种aRF 1相关蛋白）的不同机制以及aEF 1 α三种功能的分子进化。
When a stop codon appears at the ribosomal A site, the class I and II release factors (RFs) terminate translation. In eukaryotes and archaea, the class I and II RFs form a heterodimeric complex, and complete the overall translation termination process in a GTP-dependent manner. However, the structural mechanism of the translation termination by the class I and II RF complex remains unresolved. In archaea, archaeal elongation factor 1 alpha (aEF1α), a carrier GTPase for tRNA, acts as a class II RF by forming a heterodimeric complex with archaeal RF1 (aRF1). We report the crystal structure of the aRF1·aEF1α complex, the first active class I and II RF complex. This structure remarkably resembles the tRNA·EF–Tu complex, suggesting that aRF1 is efficiently delivered to the ribosomal A site, by mimicking tRNA. It provides insights into the mechanism that couples GTP hydrolysis by the class II RF to stop codon recognition and peptidyl-tRNA hydrolysis by the class I RF. We discuss the different mechanisms by which aEF1α recognizes aRF1 and aPelota, another aRF1-related protein and molecular evolution of the three functions of aEF1α.
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DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
影响因子：
64.8
作者：
Laurberg, Martin;Asahara, Haruichi;Noller, Harry F.
通讯作者：
Noller, Harry F.
影响因子：
64.5
作者：
Alkalaeva, Elena Z.;Pisarev, Andrey V.;Pestova, Tatyana V.
通讯作者：
Pestova, Tatyana V.
影响因子：
10.5
作者：
Cheng, Zhihong;Saito, Kazuki;Song, Haiwei
通讯作者：
Song, Haiwei
DOI：
10.1073/pnas.91.13.5848
发表时间：
1994-06-21
影响因子：
11.1
作者：
GRENTZMANN, G;BRECHEMIERBAEY, D;BUCKINGHAM, RH
通讯作者：
BUCKINGHAM, RH