Functional mimicry revealed by the crystal structure of an eIF4A:RNA complex bound to the interfacial inhibitor, desmethyl pateamine A.
Functional mimicry revealed by the crystal structure of an eIF4A:RNA complex bound to the interfacial inhibitor, desmethyl pateamine A.
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DOI：
10.1016/j.chembiol.2020.12.006
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发表时间：
2021-06-17
影响因子：
8.6
通讯作者：
Pelletier J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Naineni SK;Liang J;Hull K;Cencic R;Zhu M;Northcote P;Teesdale-Spittle P;Romo D;Nagar B;Pelletier J
界面抑制剂是通过与两个大分子相互作用而发挥其生物学效应的。Pateamine A（PatA）类分子通过将真核起始因子（eIF）4A RNA解旋酶稳定到RNA上而发挥功能，导致翻译起始抑制。在这里，我们提出了第一个晶体结构的eIF 4A 1：RNA复合物绑定到一个类似物的海洋海绵衍生的天然产物PatA，C5-去甲基帕特胺A（DMPatA）。这种小分子的一端楔入两个RNA碱基之间，而另一端则由几个蛋白质残基支撑。引人注目的是，DMPatA与eIF 4A 1：RNA复合物的相互作用方式与罗格列胺A（RocA）几乎相同，尽管从结构角度来看完全无关。与RocA相比，结构数据合理化了PatA类似物靶向更广泛的RNA底物的能力。我们定义了DMPatA如何能够将eIF 4A 1夹在RNA上的分子基础，从而赋予该分子有效的抑制特性。
Interfacial inhibitors exert their biological effects through co-association with two macromolecules. The pateamine A (PatA) class of molecules function by stabilizing eukaryotic initiation factor (eIF) 4A RNA helicase onto RNA, resulting in translation initiation inhibition. Here, we present the first crystal structure of an eIF4A1:RNA complex bound to an analogue of the marine sponge-derived natural product PatA, C5-desmethyl pateamine A (DMPatA). One end of this small molecule wedges itself between two RNA bases while the other end is cradled by several protein residues. Strikingly, DMPatA interacts with the eIF4A1:RNA complex in an almost identical fashion as rocaglamide A (RocA), despite being completely unrelated from a structural standpoint. The structural data rationalizes the ability of PatA analogues to target a wider range of RNA substrates compared to RocA. We define the molecular basis of how DMPatA is able to clamp eIF4A1 onto RNA, imparting potent inhibitory properties to this molecule.
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DOI：
10.1006/meth.1996.0431
发表时间：
1997-04-01
期刊：
METHODS-A COMPANION TO METHODS IN ENZYMOLOGY
影响因子：
--
作者：
Merrick, WC;Sonenberg, N
通讯作者：
Sonenberg, N
影响因子：
5.7
作者：
Kuznetsov G;Xu Q;Rudolph-Owen L;Tendyke K;Liu J;Towle M;Zhao N;Marsh J;Agoulnik S;Twine N;Parent L;Chen Z;Shie JL;Jiang Y;Zhang H;Du H;Boivin R;Wang Y;Romo D;Littlefield BA
通讯作者：
Littlefield BA
DOI：
10.1073/pnas.0504249102
发表时间：
2005-07-26
影响因子：
11.1
作者：
Bordeleau, ME;Matthews, J;Pelletier, J
通讯作者：
Pelletier, J
DOI：
10.1107/s0907444910026582
发表时间：
2010-11-01
影响因子：
2.2
作者：
Afonine, Pavel V.;Mustyakimov, Marat;Adams, Paul D.
通讯作者：
Adams, Paul D.
影响因子：
64.8
作者：
Iwasaki S;Floor SN;Ingolia NT
通讯作者：
Ingolia NT