PatchDock and SymmDock: servers for rigid and symmetric docking.
PatchDock and SymmDock: servers for rigid and symmetric docking.
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DOI：
10.1093/nar/gki481
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发表时间：
2005-07-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Wolfson HJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Schneidman-Duhovny D;Inbar Y;Nussinov R;Wolfson HJ
在这里，我们描述了两个免费提供的用于分子对接的Web服务器。PatchDock方法用于预测蛋白质-蛋白质和蛋白质-小分子复合体的结构。在给定单体单元结构的情况下，SymmDock方法预测具有循环对称性的同聚多聚体的结构。服务器的输入要么是蛋白质PDB编码，要么是上传的蛋白质结构。这些服务可在以下网址获得。服务器背后的方法非常高效，允许进行大规模的对接实验。
Here, we describe two freely available web servers for molecular docking. The PatchDock method performs structure prediction of protein–protein and protein–small molecule complexes. The SymmDock method predicts the structure of a homomultimer with cyclic symmetry given the structure of the monomeric unit. The inputs to the servers are either protein PDB codes or uploaded protein structures. The services are available at . The methods behind the servers are very efficient, allowing large-scale docking experiments.
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