BlastGUI: A Python-based Cross-platform Local BLAST Visualization Software
BlastGUI: A Python-based Cross-platform Local BLAST Visualization Software
复制标题
BlastGUI：基于 Python 的跨平台本地 BLAST 可视化软件
DOI：
10.1002/minf.201900120
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发表时间：
2020-04-01
影响因子：
3.6
通讯作者：
Luo Wei
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Du Zongjun;Wu Qing;Luo Wei
许多研究人员使用BLAST+软件来建立数据库和进行序列比对。然而，命令行操作是必需的，这为计算机技能薄弱的研究人员造成了障碍。因此，我们设计了一个基于Python编程语言的本地BLAST可视化软件BlastGUI，使用户能够通过图形用户界面构建数据库并进行序列过滤和序列比对。操作可视化、自动序列过滤和跨平台利用显著促进了生物数据分析和信息挖掘。我们设计的软件可以在https://github.com/byemaxx/BlastGUI上根据GNU GPL v3条款免费获得。
Many researchers use BLAST+ software to build databases and perform sequence alignments. However, command-line operations are required and this created a barrier for researchers with weak computer skills. Therefore, we designed BlastGUI, a Local BLAST visualization software based on Python programming language, to enable users to build databases and perform sequence filtering and sequence alignment through a graphical user interface. The operation visualization, automatic sequence filtering, and cross-platform utilization significantly facilitate biological data analysis and information mining. Our designed software is freely available under the terms of the GNU GPLv3 at https://github.com/byemaxx/BlastGUI.