Analysis of oxidative titrations of Desulfovibrio gigas hydrogenase; implications for the catalytic mechanism.
Analysis of oxidative titrations of Desulfovibrio gigas hydrogenase; implications for the catalytic mechanism.
复制标题
巨大脱硫弧菌氢化酶的氧化滴定分析；
DOI：
10.1021/bi00251a048
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发表时间：
1994
期刊：
影响因子：
2.9
通讯作者：
P. Lindahl
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
L. Roberts;P. Lindahl
从Desulfovibrio gigas中提取氢化酶（Hase）的氧化滴定[Barondeau， D. P., Roberts， L. M., & Lindahl， P. A. (1994) J. Am。化学。Soc. 116, 3442]用酶氧化还原反应的模型描述进行了模拟。该模型假设Hase包含一个[Fe3S4]1+/0簇，两个[Fe4S4]2+/1+簇，以及一个稳定在四种氧化还原态（Ni- b, Ni- si， Ni- c和Ni- r）的Ni中心，每个Ni中心被一个电子分开。Ni- si、Ni- c和Ni- r分别对应于镍（2+）二硫醇、镍（1+）二硫醇和镍（2+）二硫醇氢化物的模型与Ni中心所有已建立的相关性质相容。该模型和氧化还原微态的概念被用来定义酶的电子态，并重新阐述Cammack等人最初提出的催化机制[Cammack， R., Patil， D. S., Hatchikian， E. C., & Fernandez， V. M. (1987) Biochim]。Biophys。[j] [j]。这些循环在Fe4S4簇的平均氧化水平上有所不同。被氧化团簇最多的循环似乎是可逆的（催化H2氧化和H+还原），而那些被氧化团簇最多的循环只氧化H2。可逆性的差异可以通过假设Ni-R更倾向于还原[Fe4S4]2+簇而不是H+，并且H+只有在Fe4S4簇处于还原状态时才会被还原来解释。
The oxidative titrations of hydrogenase (Hase) from Desulfovibrio gigas [Barondeau, D. P., Roberts, L. M., & Lindahl, P. A. (1994) J. Am. Chem. Soc. 116, 3442] were simulated using model descriptions of the redox reactions in the enzyme. The data fit best to a model that assumed Hase contains one [Fe3S4]1+/0 cluster, two [Fe4S4]2+/1+ clusters, and a Ni center stable in four redox states (Ni-B, Ni-SI, Ni-C, and Ni-R), each separated by one electron. A model in which Ni-SI, Ni-C, and Ni-R correspond to Nickel(2+) dithiolate, nickel(1+) dithiol, and nickel(2+) dithiol hydride, respectively, is compatible with all established relevant properties of the Ni center. This model and the concept of redox microstates were employed to define electronic states of the enzyme and to reformulate the catalytic mechanism initially proposed by Cammack et al. [Cammack, R., Patil, D. S., Hatchikian, E. C., & Fernandez, V. M. (1987) Biochim. Biophys. Acta 912, 98] into three interconnected catalytic cycles. These cycles differ in the average oxidation level of the Fe4S4 clusters. The cycle with the most reduced clusters appears to operate reversibly (catalyzing both H2 oxidation and H+ reduction), while those with more oxidized clusters function only to oxidize H2. The difference in reversibility is explained by assuming that Ni-R prefers to reduce an [Fe4S4]2+ cluster instead of H+ and that H+ is reduced only when that Fe4S4 cluster is in its reduced state.
来自热自养甲烷杆菌的含镍脱氮黄素还原氢化酶中的顺磁性中心。
DOI：
10.1073/pnas.80.2.378
发表时间：
1983
影响因子：
11.1
作者：
Kojima,N;Fox,JA;Hausinger,RP;Daniels,L;Orme-Johnson,WH;Walsh,C
通讯作者：
Walsh,C
氢气下产生的 Desulfovibrio gigas [NiFe] 氢化酶的氧化还原中间体。
DOI：
--
发表时间：
1989
期刊：
The Journal of biological chemistry
影响因子：
--
作者：
Teixeira,M;Moura,I;Xavier,AV;Moura,JJ;LeGall,J;DerVartanian,DV;PeckJr,HD;Huynh,BH
通讯作者：
Huynh,BH
电子顺磁共振研究巨大脱硫弧菌含镍氢化酶的活化机制和催化循环。
DOI：
--
发表时间：
1985
期刊：
The Journal of biological chemistry
影响因子：
--
作者：
Teixeira,M;Moura,I;Xavier,AV;Huynh,BH;DerVartanian,DV;PeckJr,HD;LeGall,J;Moura,JJ
通讯作者：
Moura,JJ