Automated design of synthetic ribosome binding sites to control protein expression.
Automated design of synthetic ribosome binding sites to control protein expression.
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DOI：
10.1038/nbt.1568
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发表时间：
2009-10
影响因子：
46.9
通讯作者：
Voigt, Christopher A.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Salis, Howard M.;Mirsky, Ethan A.;Voigt, Christopher A.
微生物工程通常需要对蛋白质表达进行精细控制；例如，连接基因回路或通过代谢途径控制通量。我们开发了一种合成核糖体结合位点的预测设计方法，可以按比例合理控制蛋白质的生产速度。对大肠杆菌100多个预测的实验验证表明，该方法在10万倍的范围内精确到2.3倍。该设计方法还正确地预测了在不同遗传背景下重复使用核糖体结合位点序列会导致不同的蛋白质表达水平。我们通过合理优化蛋白质的表达水平，将遗传传感器连接到合成电路，证明了该方法的实用性。提出的正演工程方法将加速大型遗传系统的构建和系统优化。
Microbial engineering often requires fine control over protein expression; for example, to connect genetic circuits or control flux through a metabolic pathway. We have developed a predictive design method for synthetic ribosome binding sites that enables the rational control of a protein's production rate on a proportional scale. Experimental validation of over 100 predictions in Escherichia coli shows that the method is accurate to within a factor of 2.3 over a range of 100,000-fold. The design method also correctly predicts that reusing a ribosome binding site sequence in different genetic contexts can result in different protein expression levels. We demonstrate the method's utility by rationally optimizing a protein's expression level to connect a genetic sensor to a synthetic circuit. The proposed forward engineering approach will accelerate the construction and systematic optimization of large genetic systems.
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影响因子：
14.9
作者：
Chubiz LM;Rao CV
通讯作者：
Rao CV
影响因子：
46.9
作者：
Pfleger, Brian F.;Pitera, Douglas J.;Keasling, Jay D.
通讯作者：
Keasling, Jay D.
DOI：
10.1073/pnas.211266898
发表时间：
2001-10-09
影响因子：
11.1
作者：
Sengupta, J;Agrawal, RK;Frank, J
通讯作者：
Frank, J
大肠杆菌的系统代谢工程，用于L-苏氨酸生产。
影响因子：
9.9
作者：
Lee, Kwang Ho;Park, Jin Hwan;Kim, Tae Yong;Kim, Hyun Uk;Lee, Sang Yup
通讯作者：
Lee, Sang Yup
影响因子：
8.4
作者：
Anthony, Jennifer R.;Anthony, Larry C.;Keasling, Jay D.
通讯作者：
Keasling, Jay D.