Structural basis for selectivity in a highly reducing type II polyketide synthase.
Structural basis for selectivity in a highly reducing type II polyketide synthase.
复制标题
DOI：
10.1038/s41589-020-0530-0
复制
发表时间：
2020-07
影响因子：
14.8
通讯作者：
Ohnishi Y
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Du D;Katsuyama Y;Horiuchi M;Fushinobu S;Chen A;Davis TD;Burkart MD;Ohnishi Y
在II型聚酮酶（PKS）中，酮酶-链长因子（KS-CLF）复合物催化聚酮链与酰基载体蛋白（ACP）的延伸。以IgaPKS为代表的高度还原的II型PKS产生多烯结构，而不是众所周知的芳族骨架。在这里，我们报告的Iga 11-Iga 12（KS-CLF）异二聚体和共价交联的Iga 10 = Iga 11-Iga 12（ACP=KS-CLF）三方复合物的晶体结构。后者的结构揭示了Iga 10和Iga 11-Iga 12之间相互作用的分子基础，这不同于大肠杆菌脂肪酸合酶的ACP和KS之间的相互作用。此外，反应口袋结构和定点突变揭示Iga 11的Asp 113的负电荷阻止使用β-酮酰基产物作为底物的进一步缩合，这将IgaPKS与典型的II型PKS区分开来。这一工作将有助于今后PKS的合理设计。
In type II polyketide synthases (PKSs), the ketosynthase-chain length factor (KS-CLF) complex catalyzes polyketide chain elongation with the acyl carrier protein (ACP). Highly reducing type II PKSs, represented by IgaPKS, produce polyene structures instead of the well-known aromatic skeletons. Here, we report the crystal structures of the Iga11-Iga12 (KS-CLF) heterodimer and the covalently cross-linked Iga10=Iga11-Iga12 (ACP=KS-CLF) tripartite complex. The latter structure revealed the molecular basis of the interaction between Iga10 and Iga11-Iga12, which differs from that between the ACP and KS of Escherichia coli fatty acid synthase. Furthermore, the reaction pocket structure and site-directed mutagenesis revealed that the negative charge of Asp 113 of Iga11 prevents further condensation using a β-ketoacyl product as a substrate, which distinguishes IgaPKS from typical type II PKSs. This work will facilitate the future rational design of PKSs.
登录
查看更多内容
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
14.8
作者：
Kelley LA;Mezulis S;Yates CM;Wass MN;Sternberg MJ
通讯作者：
Sternberg MJ
DOI：
10.1073/pnas.1818686116
发表时间：
2019-04-02
影响因子：
11.1
作者：
Dodge, Greg J.;Patel, Ashay;Burkart, Michael D.
通讯作者：
Burkart, Michael D.
影响因子：
16.8
作者：
Keatinge-Clay, A;Maltby, DA;Stroud, RM
通讯作者：
Stroud, RM
影响因子：
2.9
作者：
Dreier, J;Khosla, C
通讯作者：
Khosla, C