The dawning era of comprehensive transcriptome analysis in cellular microbiology.
The dawning era of comprehensive transcriptome analysis in cellular microbiology.
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DOI：
10.3389/fmicb.2010.00118
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发表时间：
2010
影响因子：
5.2
通讯作者：
Nakagawa I
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Aikawa C;Maruyama F;Nakagawa I
细菌在感染过程中迅速改变其转录模式以适应宿主环境。为了研究宿主-细菌相互作用，已经使用了各种策略，包括使用动物感染模型、体外测定系统和显微镜观察。然而，这些研究主要集中在细菌中的一些特定基因和分子上。高密度平铺阵列和大规模并行测序分析正在通过细菌转录组的鉴定和表征快速提高我们对复杂宿主-细菌相互作用的理解。从这些高通量技术产生的信息将继续提供新的信息的复杂性，可塑性和细菌转录组的调节，以及它们的适应性反应相对于致病性。在这里，我们总结了最近的研究使用这些新技术，并讨论了转录组分析的效用。
Bacteria rapidly change their transcriptional patterns during infection in order to adapt to the host environment. To investigate host–bacteria interactions, various strategies including the use of animal infection models, in vitro assay systems and microscopic observations have been used. However, these studies primarily focused on a few specific genes and molecules in bacteria. High-density tiling arrays and massively parallel sequencing analyses are rapidly improving our understanding of the complex host–bacterial interactions through identification and characterization of bacterial transcriptomes. Information resulting from these high-throughput techniques will continue to provide novel information on the complexity, plasticity, and regulation of bacterial transcriptomes as well as their adaptive responses relative to pathogenecity. Here we summarize recent studies using these new technologies and discuss the utility of transcriptome analysis.
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影响因子：
4.4
作者：
Audic, Stephane;Lescot, Magali;Scholz, Holger C.
通讯作者：
Scholz, Holger C.
DOI：
10.1073/pnas.0807227105
发表时间：
2008-12-09
影响因子：
11.1
作者：
Cho, Byung-Kwan;Barrett, Christian L.;Palsson, Bernhard O.
通讯作者：
Palsson, Bernhard O.
影响因子：
3.2
作者：
Christiansen, JK;Larsen, MH;Kallipolitis, BH
通讯作者：
Kallipolitis, BH
影响因子：
3.2
作者：
Foster, Jeffrey T.;Beckstrom-Sternberg, Stephen M.;Keim, Paul
通讯作者：
Keim, Paul
影响因子：
6.5
作者：
ADES, EW;CANDAL, FJ;LAWLEY, TJ
通讯作者：
LAWLEY, TJ