BAC selection of the large white butterfly, Pieris brassicae (Lepidoptera: Pieridae) containing orthologs of the silkworm, Bombyx mori (Lepidoptera: Bombycidae)

BAC selection of the large white butterfly, Pieris brassicae (Lepidoptera: Pieridae) containing orthologs of the silkworm, Bombyx mori (Lepidoptera: Bombycidae)
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BAC 选择含有家蚕 Bombyx mori(鳞翅目:Bombycidae)直向同源物的大白蝴蝶,Pieris braslicae(鳞翅目:Pieridae)

DOI:
10.1007/s13355-019-00665-7
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发表时间:
2020
影响因子:
1.3
通讯作者:
Sahara K
Sahara K
中科院分区:
农林科学3区
文献类型:
--
作者:
Ohno M;Fujimoto T;Naito Y;Joraku A;Yasukochi Y;Sahara K

文献摘要

参考文献

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以大白蝶(Pieris brassicae, L.)为材料,构建了细菌人工染色体文库。(鳞翅目:蝶科),共有15360个克隆,平均插入大小为103 kb。我们设计了39对简并寡核苷酸引物,并克隆了PCR产物进行测序。从这些数据中,我们设计了单标记序列引物,并使用三步PCR方案选择了40个BAC克隆。另外对40个bac进行测序,以提高p的鉴定。家蚕(Bombyx mori, L.)中携带同源物的brassicaeBACs(鳞翅目:蚕蛾科)。在34个含有多个b。在形态学上,27个bac中的序列对应于每个b的一个块(小于1mb)。morichromosome。而5个bac的直同源物与每个b均共线性。在距离(1.4-6.8 Mb)的染色体上,两个bac的同源物对应于两个以上不同的b。morichromosomes。
We constructed a bacterial artificial chromosome (BAC) library from the large white butterfly,Pieris brassicae(L.) (Lepidoptera: Pieridae), which composed of 15,360 clones with an average insert size of 103 kb. We designed 39 degenerate oligonucleotide primer pairs and cloned the PCR products for sequencing. From these pluspierisindata, we designed single tagged sequence primers and selected 40 BAC clones using a 3-step PCR protocol. Additional 40 BACs were sequenced to improve identification ofP. brassicaeBACs carrying orthologs of the silkworm,Bombyx mori(L.) (Lepidoptera: Bombycidae). Among 34 BAC clones containing multipleB. moriorthologs, sequences in 27 BACs correspond to a block (less than 1 Mb) of everyB. morichromosome. While orthologs in 5 BACs showed collinearity to eachB. morichromosome with a distance (1.4–6.8 Mb), orthologs in two BACs corresponded to genes in more than two differentB. morichromosomes.
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