Insights into the cellular function of YhdE, a nucleotide pyrophosphatase from Escherichia coli.
Insights into the cellular function of YhdE, a nucleotide pyrophosphatase from Escherichia coli.
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深入了解 YhdE（一种来自大肠杆菌的核苷酸焦磷酸酶）的细胞功能
DOI：
10.1371/journal.pone.0117823
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发表时间：
2015
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Jia Z
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Jin J;Wu R;Zhu J;Yang S;Lei Z;Wang N;Singh VK;Zheng J;Jia Z
YhdE是大肠杆菌中一种类似Maf的蛋白，具有核苷酸焦磷酸酶(PPase)活性，但其细胞功能尚不清楚。在这里，我们表征了YhdE在dTTP、UTP和TTP上的PPase活性，并确定了YhdE的两种晶体结构，揭示了一种适应性活性中心的‘封闭’和‘开放’构象。我们的功能研究表明，YhdE通过延长延迟期和对数期来抑制细胞生长，特别是在应激条件下。形态研究表明，yhdE-基因敲除细胞将野生型细胞的正常杆状转变为更球形，细胞壁似乎变得更有弹性。相反，YhdE过表达导致了丝状细胞。这项研究揭示了YhdE在应激条件下细胞生长抑制、细胞分裂停滞和细胞形状维持中的未知参与，突显了YhdE在大肠杆菌细胞周期检查点中的重要作用。
YhdE, a Maf-like protein in Escherichia coli, exhibits nucleotide pyrophosphatase (PPase) activity, yet its cellular function remains unknown. Here, we characterized the PPase activity of YhdE on dTTP, UTP and TTP and determined two crystal structures of YhdE, revealing ‘closed’ and ‘open’ conformations of an adaptive active site. Our functional studies demonstrated that YhdE retards cell growth by prolonging the lag and log phases, particularly under stress conditions. Morphology studies showed that yhdE-knockout cells transformed the normal rod shape of wild-type cells to a more spherical form, and the cell wall appeared to become more flexible. In contrast, YhdE overexpression resulted in filamentous cells. This study reveals the previously unknown involvement of YhdE in cell growth inhibition under stress conditions, cell-division arrest and cell-shape maintenance, highlighting YhdE’s important role in E. coli cell-cycle checkpoints.
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DOI：
10.1073/pnas.97.12.6328
发表时间：
2000-06-06
影响因子：
11.1
作者：
Minasov, G;Teplova, M;Egli, M
通讯作者：
Egli, M
大肠杆菌K-12的构造框架，单基因敲除突变体：Keio Collection。
影响因子：
9.9
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
11.4
作者：
Li, ZW;Pandit, S;Deutscher, MP
通讯作者：
Deutscher, MP
影响因子：
3.2
作者：
Trusca, D;Scott, S;Bramhill, D
通讯作者：
Bramhill, D
影响因子：
3.6
作者：
Leaver, M;Errington, J
通讯作者：
Errington, J