DbVar and DGVa: public archives for genomic structural variation.
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DOI：
10.1093/nar/gks1213
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发表时间：
2013-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Church DM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lappalainen I;Lopez J;Skipper L;Hefferon T;Spalding JD;Garner J;Chen C;Maguire M;Corbett M;Zhou G;Paschall J;Ananiev V;Flicek P;Church DM
在过去的两年中，DGVA（http://www.ebi.ac.uk/dgva）和dbvar（http://www.ncbi.nlm.nlm.nih.gov/dbvar）发生了很多变化。我们现在正在处理直接提交的内容，而不仅仅是策划文献中的数据，我们的联合研究目录包括来自11种生物的100多个研究的数据。来自人类的研究以对照组和病例种群，肿瘤样本以及来自多个来源的三项大型策划研究的统治而占主导地位。在处理这些数据期间，我们对数据模型，提交过程和数据表示进行了改进。此外，我们在通过Web和FTP接口提供对这些数据的访问方面做出了重大改进。
Much has changed in the last two years at DGVa (http://www.ebi.ac.uk/dgva) and dbVar (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbvar). We are now processing direct submissions rather than only curating data from the literature and our joint study catalog includes data from over 100 studies in 11 organisms. Studies from human dominate with data from control and case populations, tumor samples as well as three large curated studies derived from multiple sources. During the processing of these data, we have made improvements to our data model, submission process and data representation. Additionally, we have made significant improvements in providing access to these data via web and FTP interfaces.
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