A robust phylogenomic framework for the calamoid palms.
A robust phylogenomic framework for the calamoid palms.
复制标题
蝾螈棕榈的强大系统发育框架。
DOI：
10.1016/j.ympev.2020.107067
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发表时间：
2021
影响因子：
4.1
通讯作者：
Kuhnhäuser BG
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kuhnhäuser BG
得到充分支持的遗传学是研究地球上生命进化和多样性的先决条件。Calamoideae亚科占棕榈科（槟榔科）的五分之一以上，分布在世界各地的热带雨林中，并支持数十亿美元的棕榈产品产业。它包含CA。该属共有17属550种，分属于10个亚族和3个族。在这里，我们测序了近1000个核基因组区域的75个系统选择的Calamoideae，代表所有菖蒲属内的分类多样性。我们的基因组分析解决了一个最大限度地支持的系统发育骨干的Calamoideae，包括几个更高层次的关系，以前没有推断。深入的分析揭示了低基因树的骨干冲突，但复杂的深层次的进化历史中的几个亚部落。总的来说，我们的基因组框架揭示了棕榈树的进化，并为未来的比较研究，如分类学，系统学，地理学和宏观进化研究提供了坚实的基础。
Well-supported phylogenies are a prerequisite for the study of the evolution and diversity of life on earth. The subfamily Calamoideae accounts for more than one fifth of the palm family (Arecaceae), occurs in tropical rainforests across the world, and supports a billion-dollar industry in rattan products. It contains ca. 550 species in 17 genera, 10 subtribes and three tribes, but their phylogenetic relationships remain insufficiently understood. Here, we sequenced almost one thousand nuclear genomic regions for 75 systematically selected Calamoideae, representing the taxonomic diversity within all calamoid genera. Our phylogenomic analyses resolved a maximally supported phylogenetic backbone for the Calamoideae, including several higher-level relationships not previously inferred. In-depth analysis revealed low gene tree conflict for the backbone but complex deep evolutionary histories within several subtribes. Overall, our phylogenomic framework sheds new light on the evolution of palms and provides a robust foundation for future comparative studies, such as taxonomy, systematics, biogeography, and macroevolutionary research.
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来自菲律宾石灰岩森林的两种新藤类（菖蒲、槟榔科）
影响因子：
1.1
作者：
Jiro T. Adorador;E. Fernando
通讯作者：
E. Fernando
菖蒲属（槟榔科、Calamoideae、Calameae、Calaminae）的修订版
DOI：
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发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
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作者：
Andrew Henderson
通讯作者：
Andrew Henderson
DOI：
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发表时间：
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期刊：
影响因子：
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作者：
O. Beccari
通讯作者：
O. Beccari
Raphia Beauv 属的修订版。
DOI：
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发表时间：
1982
期刊：
影响因子：
--
作者：
M. Otedoh
通讯作者：
M. Otedoh
影响因子：
2.7
作者：
Borowiec ML
通讯作者：
Borowiec ML