Ensifer alkalisoli YIC4027趋化受体基因的比较及相关蛋白序列分析
Ensifer alkalisoli YIC4027趋化受体基因的比较及相关蛋白序列分析
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DOI：
10.13343/j.cnki.wsxb.20200637
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发表时间：
2021-08
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
解志红
中科院分区：
文献类型：
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作者：
王艺璇;党消消;董小燕;骆永明;解志红
【目的】田菁共生根瘤菌Ensifer alkalisoli YIC4027是从宿主植物田菁的根瘤中分离出来的一株新型高效的固氮菌。本研究对E.alkalisoli的趋化受体基因与其他研究透彻的物种进行比较以及相关蛋白分析。【方法】利用NCBI的BLAST对E.alkalisoli趋化受体基因进行序列相似性搜索。以Pfam数据库为基础,用HMMR3对甲基化趋化受体蛋白(MCP)进行比较分析。【结果】E.alkalisoli有2个趋化基因簇,共有13个MCP,含有不同的信号传感结构。此外,这些MCPs的胞质结构域除了一个是由40个七肽重复序列组成,其余都是由36个七肽重复序列组成。【结论】尽管E.alkalisoli的趋化受体与已被广泛研究的物种的趋化受体具有较高的相似性,但仍显示出其特性。通过基因的比对以及相关蛋白的分析,我们能够更好地理解E.alkalisoli是如何通过趋化系统来响应外界变化的。