AlphaSimR: an R package for breeding program simulations.
AlphaSimR: an R package for breeding program simulations.
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DOI：
10.1093/g3journal/jkaa017
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发表时间：
2021-02-09
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Hickey JM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gaynor RC;Gorjanc G;Hickey JM
本文介绍了AlphaSimR，一个用于植物和动物育种计划随机模拟的R软件包。AlphaSimR是一个高度灵活的软件包，能够模拟二倍体和同源多倍体物种的各种植物和动物育种计划。AlphaSimR非常适合测试育种计划的总体策略和详细设计。AlphaSimR利用脚本方法来构建模拟，特别适合于建模高度复杂的育种计划，如商业育种计划。这种脚本方法的主要好处是它将用户从预设的育种程序设计中解放出来，并允许他们模拟几乎任何育种程序设计。本文列出了AlphaSimR的主要功能，并提供了一个简短的示例仿真来展示如何使用该软件。
This paper introduces AlphaSimR, an R package for stochastic simulations of plant and animal breeding programs. AlphaSimR is a highly flexible software package able to simulate a wide range of plant and animal breeding programs for diploid and autopolyploid species. AlphaSimR is ideal for testing the overall strategy and detailed design of breeding programs. AlphaSimR utilizes a scripting approach to building simulations that is particularly well suited for modeling highly complex breeding programs, such as commercial breeding programs. The primary benefit of this scripting approach is that it frees users from preset breeding program designs and allows them to model nearly any breeding program design. This paper lists the main features of AlphaSimR and provides a brief example simulation to show how to use the software.
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通讯作者：
Morris, Geoffrey P.
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通讯作者：
Hickey, John M.
DOI：
10.1186/s12711-015-0135-3
发表时间：
2015-07-02
期刊：
Genetics, selection, evolution : GSE
影响因子：
--
作者：
Jenko J;Gorjanc G;Cleveland MA;Varshney RK;Whitelaw CB;Woolliams JA;Hickey JM
通讯作者：
Hickey JM