Comparative phosphoproteomic analysis of neonatal and adult murine brain.
Comparative phosphoproteomic analysis of neonatal and adult murine brain.
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DOI：
10.1002/pmic.201200003
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发表时间：
2012-07
期刊：
影响因子：
3.4
通讯作者：
Ballif, Bryan A.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Goswami, Tapasree;Li, Xue;Smith, Aidan M.;Luderowski, Eva M.;Vincent, James J.;Rush, John;Ballif, Bryan A.
关键词：
发育过程受不同的调控机制控制，包括一系列使用可逆磷酸化的信号通路。随着大规模磷酸蛋白质组学的出现，现在有可能从不同发育阶段的组织中识别数千个磷酸化位点。在这里，我们描述了从新生小鼠脑中鉴定出6,000多个非冗余的磷酸化位点。与从三周大的小鼠脑中发现的近三倍的磷酸化位点相比，值得注意的是，三分之一的新生儿位点是独一无二的。当允许位点偏离正负15个残基时，这一比例仅下降到四分之一。这为发育调节的磷蛋白组谱的相当大的变化提供了证据。利用定量质谱仪，我们鉴定了一个新的磷酸化位点(Ser265)，该位点在新生儿大脑中是在双重皮质素(DCX)上唯一确定的，DCX是哺乳动物大脑正常发育所必需的蛋白质。虽然DCX和磷酸化Ser265DCX在胚胎和新生儿脑中的相对水平相似，但它们的水平在出生后第21天急剧下降，磷酸化Ser297也是如此，这是正常神经元迁移所必需的位置。这两个位点都位于微管结合域附近，可能通过不同的激酶提供相似的功能调节。
Developmental processes are governed by diverse regulatory mechanisms including a suite of signaling pathways employing reversible phosphorylation. With the advent of large-scale phosphoproteomics it is now possible to identify thousands of phosphorylation sites from tissues at distinct developmental stages. We describe here the identification of over 6,000 non-redundant phosphorylation sites from neonatal murine brain. When compared to nearly three times the number of phosphorylation sites identified from three-week-old murine brain, remarkably one-third of the neonatal sites were unique. This fraction only dropped to one-quarter when allowing the site to stray plus or minus 15 residues. This provides evidence for considerable change in the profiles of developmentally-regulated phosphoproteomes. Using quantitative mass spectrometry we characterized a novel phosphorylation site (Ser265) identified uniquely in the neonatal brain on Doublecortin (Dcx), a protein essential for proper mammalian brain development. While the relative levels of Dcx and phospho-Ser265 Dcx between embryonic and neonatal brain were similar, their levels fell precipitously by postnatal day 21, as did phospho-Ser297, a site required for proper neuronal migration. Both sites lie near the microtubule-binding domain and may provide functionally similar regulation via different kinases.
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影响因子：
64.5
作者：
Huttlin EL;Jedrychowski MP;Elias JE;Goswami T;Rad R;Beausoleil SA;Villén J;Haas W;Sowa ME;Gygi SP
通讯作者：
Gygi SP
影响因子：
14.8
作者：
Rappsilber, Juri;Mann, Matthias;Ishihama, Yasushi
通讯作者：
Ishihama, Yasushi
影响因子：
5.3
作者：
Buchou, T;Vernet, M;Boldyreff, B
通讯作者：
Boldyreff, B
影响因子：
5.3
作者：
Huillard, Emmanuelle;Ziercher, Lea;Buchou, Thierry
通讯作者：
Buchou, Thierry
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14.9
作者：
Obenauer, JC;Cantley, LC;Yaffe, MB
通讯作者：
Yaffe, MB