The complete chloroplast genome sequence of the evergreen plant Dendropanax dentiger (Araliaceae)
The complete chloroplast genome sequence of the evergreen plant Dendropanax dentiger (Araliaceae)
复制标题
常绿植物 Dendropanax dentiger（五加科）的完整叶绿体基因组序列
DOI：
10.3109/19401736.2014.1003909
复制
发表时间：
2016-11
影响因子：
--
通讯作者：
XiaoFeng Li
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Li Wang;Xia-Jin Du;XiaoFeng Li
利用Illumina全基因组测序数据重建了常绿植物牙齿石斛（Dendropanax dentiger）的叶绿体基因组。该环状基因组的大小为156687 bp，由一对25880 bp的反向重复（IR）区、86680 bp的大单拷贝（LSC）区和18247 bp的小单拷贝（SSC）区组成。叶绿体基因组包含134个基因，其中89个蛋白质编码基因（81个PCG种），8个核糖体RNA基因（4个rRNA种），37个转移RNA基因（30个tRNA种）。在这些基因中，16个含有一个内含子，两个含有两个内含子。全基因组A + T总含量为62.0%，而LSC、SSC和IR区对应的A + T含量分别为63.8%、68.0%和56.9%。
The complete chloroplast genome of the evergreen plant Dendropanax dentiger (Araliaceae) has been reconstructed from the whole-genome Illumina sequencing data. The circular genome is 156,687 bp in size, and comprises a pair of inverted repeat (IR) regions of 25,880 bp each, a large single-copy (LSC) region of 86,680 bp, and a small single-copy (SSC) region of 18,247 bp. The chloroplast genome contains 134 genes, including 89 protein-coding genes (81 PCG species), eight ribosomal RNA genes (four rRNA species), and 37 transfer RNA genes (30 tRNA species). Out of these genes, 16 harbor a single intron, and two contain a couple of introns. The overall A + T content of the whole genome is 62.0%, while the corresponding values of the LSC, SSC, and IR regions are 63.8%, 68.0% and 56.9%, respectively.
影响因子：
3.8
作者：
Dong-Keun Yi;Hae-Lim Lee;Byung-Yun Sun;M. Chung;Ki-Joong Kim
通讯作者：
Dong-Keun Yi;Hae-Lim Lee;Byung-Yun Sun;M. Chung;Ki-Joong Kim
影响因子：
3.7
作者：
Li R;Ma PF;Wen J;Yi TS
通讯作者：
Yi TS
直接从基因组下一代测序读取中重建线粒体基因组 - 一种诱饵和迭代映射方法。
影响因子：
14.9
作者：
Hahn C;Bachmann L;Chevreux B
通讯作者：
Chevreux B