独行菜 LaAP2 基因克隆、生物信息学分析及表达分析
独行菜 LaAP2 基因克隆、生物信息学分析及表达分析
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DOI：
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发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
赵惠新
中科院分区：
文献类型：
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作者：
李艳红;曾卫军;李金玉;葛风伟;朱艳蕾;赵惠新
AP2/EＲF 是广泛存在于植物中一类重要的转录因子，调控一些参与非生物胁迫相关基因的表达，.帮助植物提高逆境胁迫能力。为了深入探讨 LaAP2 在独行菜耐受低温萌发及幼苗耐受低温生长中的功能，.该研究基于前期对独行菜(Lepidium apetalum)转录组数据库分析，克隆获得一个显著上调表达的 AP2/EＲF.家族序列 LaAP2。该基因 cDNA 全长为1 005 bp，编码氨基酸序列包含一个 AP2 和一个 B3 结构域，属于.AP2/EＲF 转录因子 ＲAV 亚家族。推定的 LaAP2 蛋白分子量为37．744 67 kD ，等电点为 9．49。该蛋白氨基.酸序列同亚麻荠、拟南芥、油菜等物种显示出较高同源性，系统进化分析结果表明与拟南芥亲缘关系较近。.氨基酸序列分析预测表明，LaAP2 基因所编码的蛋白不具备信号肽区段，无跨膜区，不属于分泌蛋白，可能.为亲水性蛋白;定位于细胞质的可能性为 56．5%，定位于细胞核的可能性为 21．7%;其主要二级结构元件为.无规则卷曲、延伸链、α-螺旋。Ｒeal-time PCＲ 分析独行菜幼苗中 LaAP2 在低温 4 ℃ 处理下的表达，显示.LaAP2 表达受低温胁迫呈先下降后升高趋势。这表明 LaAP2 在独行菜幼苗抵抗低温胁迫中起调控作用。