VAST (Volume Annotation and Segmentation Tool): Efficient Manual and Semi-Automatic Labeling of Large 3D Image Stacks.

VAST (Volume Annotation and Segmentation Tool): Efficient Manual and Semi-Automatic Labeling of Large 3D Image Stacks.
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DOI:
10.3389/fncir.2018.00088
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发表时间:
2018
影响因子:
3.5
通讯作者:
Lichtman JW
Lichtman JW
中科院分区:
医学3区
文献类型:
--
作者:
Berger DR;Seung HS;Lichtman JW

文献摘要

参考文献

被引文献

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连续切片电子显微镜的最新发展允许高效生成非常大的图像数据集,但分析此类数据对软件工具提出了挑战。在这里,我们介绍体积注释和分割工具(VAST),一个免费提供的实用程序,用于生成和编辑注释和分割的大型体积图像(体素)数据集。它提供了一个简单而强大的用户界面,用于实时探索和分析大型数据集,即使是在PB范围内。
Recent developments in serial-section electron microscopy allow the efficient generation of very large image data sets but analyzing such data poses challenges for software tools. Here we introduce Volume Annotation and Segmentation Tool (VAST), a freely available utility program for generating and editing annotations and segmentations of large volumetric image (voxel) data sets. It provides a simple yet powerful user interface for real-time exploration and analysis of large data sets even in the Petabyte range.
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作者:
通讯作者: --