滇龙胆香叶醇-10-羟化酶基因克隆、生物信息学分析和表达

滇龙胆香叶醇-10-羟化酶基因克隆、生物信息学分析和表达
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DOI:
10.7501/j.issn.0253-2670.2017.03.020
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发表时间:
2017-02
期刊:
《中草药》
影响因子:
--
通讯作者:
刘小莉
刘小莉
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者:
周伟;吴昕怡;张琳;刘小莉

文献摘要

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目的:克隆滇龙胆Gentiana rigescens香叶醇-10-羟化酶(geraniol-1-hydroxylase,G10H)基因,对其进行定量表达以及生物信息学分析。方法 采用PCR技术获得G10H的cDNA序列,对G10H蛋白质进行理化分析、二级结构和三级结构等生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR方法检测G10H基因在滇龙胆根、茎、叶中的表达情况。结果 克隆得到滇龙胆G10H基因,全长为1400bp,ORF1248bp,编码415个氨基酸。生物信息学预测该基因编码蛋白质分子式为C2131 H3390N586O615S17,等电点为7.62,不稳定系数为44.20,疏水性系数GRAVY为-0.245.G10H基因在滇龙胆根、茎、叶中均有表达,其中在根中表达量最高,茎中最低。结论 首次从滇龙胆中克隆得到G10H基因,为进一步阐明该基因的羟基化功能在滇龙胆龙胆苦苷生物合成途径中的重要作用奠定基础。