水稻DUF966 基因家族的生物信息学分析
水稻DUF966 基因家族的生物信息学分析
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DOI：
10.13271/j.mpb.015.004791
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发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
田蕾
中科院分区：
文献类型：
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作者：
罗成科;田蕾
DUF966 基因家族是一类未知功能的基因家族，它们在水稻生长发育和逆境胁迫应答反应中可能起重要作用，为了研究这些基因的生物学功能，初步揭示它们对水稻生长发育和抗逆性的调控作用，本研究通过生物信息学方法，分析了水稻DUF966 家族基因特征、系统进化、芯片表达谱、跨膜结构域、信号肽以及亚细胞定位。结果表明，水稻DUF966 基因家族包含7 个成员，几乎都具有转录活性，它们编码的蛋白质只包含1~2 个保守的未知功能结构域(DUF966 结构域)；进化分析表明，该家族可分为4 个亚群，其中OsDSR2、OsDSR4、OsDSR5 和OsDSR6 同属一个亚群，可能具有相似的生物学功能；芯片表达谱分析表明，该家族基因主要在幼苗、花序和茎中呈中、低度表达，OsDSR3 和OsDSR7 基因受盐和低温胁迫的诱导表达，其它基因受不同非生物胁迫的抑制表达，该家族多数基因还能被白叶枯病菌侵染诱导表达；蛋白预测表明，该家族蛋白不含跨膜结构域和信号肽序列，能够被定位在细胞质中。本研究为系统开展水稻DUF966 基因家族的生物学功能研究提供了依据。