A plasma-membrane E-MAP reveals links of the eisosome with sphingolipid metabolism and endosomal trafficking.
A plasma-membrane E-MAP reveals links of the eisosome with sphingolipid metabolism and endosomal trafficking.
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DOI：
10.1038/nsmb.1829
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发表时间：
2010-07
影响因子：
16.8
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
质膜界定细胞并控制其自身与环境之间的物质和信息交换。不同的质膜过程是如何协调的，以及质膜脂质和蛋白质的相对丰度是如何保持稳态的，目前还不清楚。在这里，我们使用了定量遗传相互作用图，或E-MAP，功能询问一组约400个基因，涉及质膜生物学的各个方面，包括内吞作用，信号传导，脂质代谢和eisosome功能。从这个E-MAP中，我们得出了一组在这些不同过程中发挥作用的基因之间的57，799个个体相互作用。使用三联体遗传基序分析，我们确定了一个新的组成部分的eisosome，EMP 1，并连接到内吞和eisosome功能的特点不佳的基因EMP 70。最后，我们牵连Rom 2，一个GDP/GTP交换因子Rho 1和Rho 2，在调节鞘脂代谢。
The plasma membrane delimits the cell and controls material and information exchange between itself and the environment. How different plasma-membrane processes are coordinated and how the relative abundance of plasma-membrane lipids and proteins is homeostatically maintained are not yet understood. Here, we used a quantitative genetic interaction map, or E-MAP, to functionally interrogate a set of ~400 genes involved in various aspects of plasma-membrane biology, including endocytosis, signaling, lipid metabolism and eisosome function. From this E-MAP, we derived a set of 57,799 individual interactions between genes functioning in these various processes. Using triplet genetic motif analysis, we identified a new component of the eisosome, Eis1, and linked the poorly characterized gene EMP70 to endocytic and eisosome function. Finally, we implicated Rom2, a GDP/GTP exchange factor for Rho1 and Rho2, in the regulation of sphingolipid metabolism.
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DOI：
10.1083/jcb.200107135
发表时间：
2002-01-21
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
deHart AK;Schnell JD;Allen DA;Hicke L
通讯作者：
Hicke L
DOI：
10.1083/jcb.141.3.567
发表时间：
1998-05-04
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Brizzio V;Gammie AE;Rose MD
通讯作者：
Rose MD
DOI：
10.1083/jcb.200806035
发表时间：
2008-12-15
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Grossmann G;Malinsky J;Stahlschmidt W;Loibl M;Weig-Meckl I;Frommer WB;Opekarová M;Tanner W
通讯作者：
Tanner W
影响因子：
11.4
作者：
Friant, S;Lombardi, R;Riezman, H
通讯作者：
Riezman, H
影响因子：
3.6
作者：
Cerantola, Vanessa;Guillas, Isabelle;Conzelmann, Andreas
通讯作者：
Conzelmann, Andreas