Pathway Commons, a web resource for biological pathway data.
Pathway Commons, a web resource for biological pathway data.
复制标题
DOI：
10.1093/nar/gkq1039
复制
发表时间：
2011-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Sander C
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Cerami EG;Gross BE;Demir E;Rodchenkov I;Babur O;Anwar N;Schultz N;Bader GD;Sander C
Pathway Commons（www.pathwaycommons.org）是来自多种生物体的公开可用途径数据的集合。Pathway Commons提供了一个基于Web的界面，使生物学家能够浏览和搜索来自多个来源的以共同语言表示的途径的综合集合，一个下载网站，以标准或方便的格式提供集成的批量途径信息集，以及一个Web服务，软件开发人员可以使用它方便地查询和访问所有数据。数据库提供商可以通过一个共同的存储库共享他们的路径数据。途径包括生物化学反应、复合物组装、运输和催化事件以及涉及蛋白质、DNA、RNA、小分子和复合物的物理相互作用。Pathway Commons旨在以标准格式收集和整合所有公共途径数据。Pathway Commons目前包含来自9个数据库的数据，其中包括1400多个途径和687，000个相互作用，并将不断扩展和更新。
Pathway Commons (http://www.pathwaycommons.org) is a collection of publicly available pathway data from multiple organisms. Pathway Commons provides a web-based interface that enables biologists to browse and search a comprehensive collection of pathways from multiple sources represented in a common language, a download site that provides integrated bulk sets of pathway information in standard or convenient formats and a web service that software developers can use to conveniently query and access all data. Database providers can share their pathway data via a common repository. Pathways include biochemical reactions, complex assembly, transport and catalysis events and physical interactions involving proteins, DNA, RNA, small molecules and complexes. Pathway Commons aims to collect and integrate all public pathway data available in standard formats. Pathway Commons currently contains data from nine databases with over 1400 pathways and 687 000 interactions and will be continually expanded and updated.