Fine Sampling of Sequence Space for Membrane Protein Structural Biology.
Fine Sampling of Sequence Space for Membrane Protein Structural Biology.
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DOI：
10.1016/j.jmb.2021.167055
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发表时间：
2021-07-23
影响因子：
5.6
通讯作者：
Mancia F
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Loukeris M;Sanghai ZA;Vendome J;Hendrickson WA;Kloss B;Mancia F
我们描述了一种基于传统基因组学方法的改进，以提高膜蛋白结构确定的成功率。在广泛筛选序列空间以识别初始表达阳性靶之后，我们采用第二步来选择与这些命中密切相关的序列的同源基因。我们证明，这些后一种目标中有更大比例的目标表达良好，并且在洗涤剂中稳定，从而增加了识别最终产生结构信息的候选对象的可能性。
We describe an enhancement of traditional genomics-based approaches to improve the success of structure determination of membrane proteins. Following a broad screen of sequence space to identify initial expression-positive targets, we employ a second step to select orthologs with closely related sequences to these hits. We demonstrate that a greater percentage of these latter targets express well and are stable in detergent, increasing the likelihood of identifying candidates that will ultimately yield structural information.
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影响因子：
--
作者：
Kim, Youngchang;Bigelow, Lance;Borovilos, Maria;Dementieva, Irina;Duggan, Erika;Eschenfeldt, William;Hatzos, Catherine;Joachimiak, Grazyna;Li, Hui;Maltseva, Natalia;Mulligan, Rory;Quartey, Pearl;Sather, Alicia;Stols, Lucy;Volkart, Lour;Wu, Ruiying;Zhou, Min;Joachimiak, Andrzej
通讯作者：
Joachimiak, Andrzej
影响因子：
56.9
作者：
Locher, KP;Lee, AT;Rees, DC
通讯作者：
Rees, DC
影响因子：
5.6
作者：
BEISSINGER, M;LEE, SC;SECKLER, R
通讯作者：
SECKLER, R
DOI：
10.1007/978-1-4939-7151-0_9
发表时间：
2017-01-01
期刊：
MEMBRANE PROTEIN STRUCTURE AND FUNCTION CHARACTERIZATION: METHODS AND PROTOCOLS
影响因子：
--
作者：
Bonnete, Francoise;Loll, Patrick J.
通讯作者：
Loll, Patrick J.
影响因子：
14.9
作者：
ASLANIDIS, C;DEJONG, PJ
通讯作者：
DEJONG, PJ