Field evaluation of a novel preservation medium to transport sputum specimens for molecular detection of Mycobacterium tuberculosis in a rural African setting
Field evaluation of a novel preservation medium to transport sputum specimens for molecular detection of Mycobacterium tuberculosis in a rural African setting
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DOI：
10.1111/tmi.12701
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发表时间：
2016-06-01
影响因子：
3.3
通讯作者：
Fourie, P. Bernard
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Omar, Shaheed V.;Peters, Remco P. H.;Fourie, P. Bernard
ObjectivesTo评估一种将痰液运送到集中设施进行结核分枝杆菌分子检测的创新方法的性能：使用拭子将痰液包裹在运送培养基PrimeStore（（R））分子运送培养基（PS-MTM）中。拭子从每个标本，并放置到PS-MTM，它被处理之前，无论是液体培养或Xpert MTB/RIF检测（Xpert）。M.结核病的检出率分别为29%（培养）和29%（Xpert），而31%（培养物中PS-MTM的IS 6110实时PCR检测阳性）和36%（Xpert配对标本）。Xpert评价方法与培养物的一致性分别为82%（McNemar，P = 0.55）和84%（McNemar，P = 0.05）。按培养结果分层，IS 6110实时PCR PS-MTM对培养阳性患者的检出率与Xpert相似（P = 0.32），但如果培养阴性，则显著更高（P = 0.008）.结论痰液拭子采集到PS-MTM中运输是农村卫生机构结核病诊断的一种有前途的方法，从而潜在地改进了在不能应用分散的高科技分子检测的国家中可用于TB的分子诊断的选择。ObjectivesEvaluer la performance d 'une methode innovante de transport des carptorations vers des etablissements centralises pour la detection moleculaire de M. Tuberculosis，en utilisant un ecouvillon pour inoculatory 'sputoration dans un milieu de transport，PrimeStore（（R））Molecular Transport Medium（PS-MTM）.MethodesDeux machintillons de crachats ont埃特obtenus de patients suspected de tuberculose（TB）dans des etablissements de soins de sante en milieu rural en Afrique du Sud.结果141例患者（47例经实验室确诊为结核病）未纳入分析。M.结核病埃特在培养物中检出率为29%，Xpert为29%，而在PS-MTM培养物中，PCR IS 6110检测埃特阳性率为31%，Xpert仪器检测阳性率为36%。Xpert培养物评价过程中方法的一致性为82%（McNemar，p = 0.55）和84%（McNemar，p = 0.05）。根据培养结果分层，对培养阳性患者进行PCR IS 6110检测，同时使用类似于Xpert样本的PS-MTM样本进行检测（p = 0.32），迈斯显著性增加，如果培养阴性（p = 0，008）.结论Ces resultats mostly que la collecte par ecouvillon de crachats dans le PS-MTM pour le transport is une methode prometteuse pour le diagnosis de la TB dans les establissements de soins de sante en contrieu rural，在无法应用分子检测技术的国家中，改善了结核病诊断分子的潜在选择facon decentralisee.ObjetivosEvaluar el desempeno de un metodo innovador帕拉el transputo de esputo a laboratorios centrales帕拉la deteccion molecular de M.结核病;在PrimeStore（（R））（MTM- PS）的帕拉转运介质中接种ESPUTO，使用ESCOBILLON，在南非农村卫生保健中心进行结核病（TB）的免疫接种方法。Se utilizo un escobillon帕拉cada muestra y se coloco dentro del MTM- PS，plasma de ser processado bien un cultivo liquido or con el metodo Xpert MTB/Rif（Xpert）.ResultadosEn el analisis se incluyeron 141 patientes（incluyendo 47 con una TB confirmed en laboratorio）. Se detecto M.结核病在培养中的利用率为29%，在Xpert中的利用率为29%，在真实的IS 6110培养中的PCR结果呈阳性，在Xpert中的利用率为31%。帕拉Xpert，对培养物进行评价的方法一致性为82%（McNemar，p=0.55）和84%（McNemar，p=0.05）。培养结果分层，真实的IS 6110帕拉MTM- PS的中期PCR检测结果与Xpert帕拉阳性培养结果相似（p=0.32），佩罗significativamente mayor si el cultivo era negativo（p=0.008）.结论Estradiumresultados sugieren que la recogida de esputo con escobillon y MTM-PS后转运是一种在农村卫生中心进行结核病诊断的方法，也是在缺乏分散的分子技术方法的情况下进行结核病分子诊断的实际可采用的方法。
ObjectivesTo assess the performance of an innovative method of transporting sputum to centralised facilities for molecular detection of Mycobacterium tuberculosis: using a swab to inoculate sputum in a transport medium, PrimeStore((R)) Molecular Transport Medium (PS-MTM).MethodsTwo sputum specimens were obtained from suspected patients with tuberculosis (TB) at rural healthcare facilities in South Africa. A swab was taken from each specimen and placed into PS-MTM, prior to it being processed by either liquid culture or Xpert MTB/RIF assay (Xpert).ResultsA total of 141 patients (including 47 with laboratory-confirmed TB) were included in this analysis. M. tuberculosis was detected at 29% by culture and 29% by Xpert, whereas 31% tested positive by IS6110 real-time PCR of PS-MTM from the culture and 36% from the Xpert-paired specimen. Concordance between the method under evaluation with culture was 82% (McNemar, P = 0.55) and 84% (McNemar, P = 0.05) for Xpert. Stratified by culture result, the detection rate by IS6110 real-time PCR of PS-MTM was similar to Xpert for patients with positive culture (P = 0.32), but significantly higher if culture was negative (P = 0.008).ConclusionsThese results suggest that swab collection of sputum into PS-MTM for transport is a promising method for diagnosis of TB in rural healthcare settings, thereby potentially improving the options available for molecular diagnosis of TB in countries incapable of applying decentralised high-tech molecular testing.ObjectifsEvaluer la performance d'une methode innovante de transport des expectorations vers des etablissements centralises pour la detection moleculaire de M. Tuberculosis, en utilisant un ecouvillon pour inoculer l'expectoration dans un milieu de transport, PrimeStore((R)) Molecular Transport Medium (PS-MTM).MethodesDeux echantillons de crachats ont ete obtenus de patients suspectes de tuberculose (TB) dans des etablissements de soins de sante en milieu rural en Afrique du Sud. Un prelevement de chaque echantillon preleve par ecouvillon a ete place dans le PS-MTM, avant qu'il ne soit traite pour la culture liquide ou pour le test Xpert MTB/Rif (Xpert).Resultats141 patients (dont 47 confirmes TB au laboratoire) ont ete inclus dans cette analyse. M. tuberculosis a ete detectee dans 29% par la culture et 29% par Xpert, alors que 31% ont ete testes positifs par la PCR IS6110 en temps reel a partir de la culture de PS-MTM et 36% a partir de l'echantillon Xpert-apparie. La concordance entre la methode en cours d'evaluation avec la culture etait de 82% (McNemar, p = 0,55) et 84% (McNemar, p = 0,05) pour Xpert. Stratifie par resultat de la culture, le taux de detection par la PCR IS6110 en temps reel de PS-MTM etait similaire a celui de Xpert pour les patients avec une culture positive (p = 0,32), mais significativement plus eleve si la culture etait negative (p = 0,008).ConclusionsCes resultats suggerent que la collecte par ecouvillon de crachats dans le PS-MTM pour le transport est une methode prometteuse pour le diagnostic de la TB dans les etablissements de soins de sante en milieu rural, ameliorant ainsi potentiellement les options disponibles pour le diagnostic moleculaire de la TB dans les pays incapables d'appliquer des tests moleculaires de haute technologie de facon decentralisee.ObjetivosEvaluar el desempeno de un metodo innovador para el transporte de esputo a laboratorios centrales para la deteccion molecular de M. tuberculosis; inocular esputo, utilizando un escobillon, en el medio para transporte molecular de PrimeStore((R)) (MTM- PS).MetodosSe obtuvieron dos muestras de esputo de pacientes con sospecha de tuberculosis (TB) en centros rurales de atencion sanitaria en Sudafrica. Se utilizo un escobillon para cada muestra y se coloco dentro del MTM- PS, antes de ser procesado bien en un cultivo liquido o con el metodo Xpert MTB/Rif (Xpert).ResultadosEn el analisis se incluyeron 141 pacientes (incluyendo 47 con una TB confirmada en laboratorio). Se detecto M. tuberculosis en un 29% mediante cultivo y en un 29% utilizando Xpert, mientras que un 31% dieron un resultado positivo utilizando la PCR en tiempo real IS6110 de cultivo y un 36% utilizando la muestra asociada al Xpert. La concordancia entre el metodo que se evaluaba con el cultivo era del 82% (McNemar, p=0.55) y del 84% (McNemar, p=0.05) para Xpert. Estratificado segun el resultado del cultivo, la tasa de deteccion mediante PCR en tiempo real IS6110 para MTM- PS era similar a Xpert para pacientes con un cultivo positivo (p=0.32), pero significativamente mayor si el cultivo era negativo (p=0.008).ConclusionesEstos resultados sugieren que la recogida de esputo con escobillon y MTM- PS para su posterior transporte es un metodo prometedor para el diagnostico de la TB en centros sanitarios rurales, mejorando las opciones actualmente disponibles para el diagnostico molecular de TB en paises incapaces de aplicar metodos descentralizados de tecnologia molecular puntera.