GeLC-MS/MS analysis of complex protein mixtures.
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DOI：
10.1007/978-1-4939-0685-7_4
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发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Hansen, Kirk C.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Dzieciatkowska, Monika;Hill, Ryan;Hansen, Kirk C.
基于发现的蛋白质组学已经在生物学研究的几乎每一个方面找到了自己的位置。这种方法的一个关键目标是最大限度地扩大蛋白质在广泛浓度范围内的序列覆盖率。在蛋白质水平上对样品进行分级是规避样品复杂性和提高蛋白质组覆盖率的最常见方法之一。在现有的蛋白质组分析方法中，一维十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳联用液相色谱串联质谱仪(GeLC-MS/MS)是一种可靠的、重复性好的定性和定量蛋白质组分析方法。在这里，我们描述一个通用的GeLC-MS/MS协议，并包括技术建议和概要说明，以增加成功分析的可能性。
Discovery-based proteomics has found its place in nearly every facet of biological research. A key objective of this approach is to maximize sequence coverage for proteins across a wide concentration range. Fractionating samples at the protein level is one of the most common ways to circumvent challenges due to sample complexity and improve proteome coverage. Of the available methods, one-dimensional sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis followed by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (GeLC-MS/MS) is a robust and reproducible method for qualitative and quantitative proteomic analysis. Here we describe a general GeLC-MS/MS protocol and include technical advice and outline caveats to increase the probability of a successful analysis.
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