多能干细胞关键因子Oct4 RNA 结合蛋白的分离与鉴定

多能干细胞关键因子Oct4 RNA 结合蛋白的分离与鉴定
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DOI:
10.3969/j.issn.1674-8115.2019.01.002
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发表时间:
2019
期刊:
上海交通大学学报. 医学版
影响因子:
--
通讯作者:
曾凡一
曾凡一
中科院分区:
其他
文献类型:
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作者:
马姬;郭传亮;范书玥;薛燕;曾凡一

文献摘要

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目的·分离多能干细胞关键因子Oct4的RNA结合蛋白.方法·培养小鼠胚胎干细胞(R1),从中提取细胞总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增Oct4并转录为mRNA.采用链霉素亲和层析和质谱技术筛选候选RNA结合蛋白,采用RNA免疫沉淀技术鉴定候选RNA结合蛋白.结果·经高效液相色谱-质谱法鉴定和筛选出121个能与Oct4 3'非翻译区(untranslated region,UTR)和Oct4 5' UTR相结合的RNA结合蛋白,肽段图谱匹配数≥ 2的有11个.并对其中的7个候选RNA结合蛋白进行了进一步验证,结果显示 Oct4可与DSP、SOD1、LMNA、NPM1、PSIP1、NCL和HDGF蛋白发生相互作用,其中HDGF与Oct4结合能力最强.结论· Oct4 RNA结合蛋白的鉴定将为Oct4的调控机制提供一定理论依据,为后续其功能研究提供基础.