Enhancers as information integration hubs in development: lessons from genomics.
Enhancers as information integration hubs in development: lessons from genomics.
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DOI：
10.1016/j.tig.2012.02.008
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发表时间：
2012-06
影响因子：
11.4
通讯作者：
Wysocka, Joanna
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Buecker, Christa;Wysocka, Joanna
转录增强子是组织特异性基因表达的主要决定因素。虽然我们目前对增强子元件的大部分知识来自于对单个基因座的详细分析，但表观基因组学的最新进展已经导致了用于细胞类型特异性增强子的全面和保守独立注释的方法的发展。在这里，我们讨论了增强子映射的不同基因组方法的优点和局限性，并总结了增强子景观的全基因组视图所提供的观察结果，重点是发展。我们建议，增强子作为信息整合枢纽，在特定的细胞状态，信号环境和染色质环境的背景下读取由基因组编码的指令，允许在胚胎发生过程中对基因表达进行精确的时空控制。
Transcriptional enhancers are the primary determinants of tissue-specific gene expression. Although the majority of our current knowledge of enhancer elements comes from detailed analyses of individual loci, recent progress in epigenomics has led to the development of methods for comprehensive and conservation-independent annotation of cell type-specific enhancers. Here, we discuss the advantages and limitations of different genomic approaches to enhancer mapping and summarize observations that have been afforded by the genome-wide views of enhancer landscapes, with a focus on development. We propose that enhancers serve as information integration hubs, at which instructions encoded by the genome are read in the context of a specific cellular state, signaling milieu and chromatin environment, allowing for exquisitely precise spatiotemporal control of gene expression during embryogenesis.
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影响因子：
64.8
作者：
Ernst, Jason;Kheradpour, Pouya;Mikkelsen, Tarjei S.;Shoresh, Noam;Ward, Lucas D.;Epstein, Charles B.;Zhang, Xiaolan;Wang, Li;Issner, Robbyn;Coyne, Michael;Ku, Manching;Durham, Timothy;Kellis, Manolis;Bernstein, Bradley E.
通讯作者：
Bernstein, Bradley E.
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
44.1
作者：
Hawkins, R. David;Hon, Gary C.;Ren, Bing
通讯作者：
Ren, Bing
影响因子：
4
作者：
Barolo, Scott
通讯作者：
Barolo, Scott
影响因子：
2.7
作者：
Aday AW;Zhu LJ;Lakshmanan A;Wang J;Lawson ND
通讯作者：
Lawson ND