通过WGCNA建立食管鳞癌放射敏感性的microRNA表达模型
通过WGCNA建立食管鳞癌放射敏感性的microRNA表达模型
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DOI：
10.7652/jdyxb202005003
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发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
杨蕴一
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
孙宇晨;孙玄子;李静;师小博;赵旭;苏亚妮;张晓智;杨蕴一
目的筛选并验证影响食管鳞癌放射敏感性的microRNAs。方法基于TCGA数据库及食管鳞癌患者的组织标本,利用WGCNA算法及qRT-PCR筛选并验证放射敏感相关的核心microRNAs。Logistic联合ROC评估预测模型的准确性。克隆形成实验验证microRNAs对食管鳞癌放射敏感性的影响。TargetScan及Western blotting验证microRNAs与靶基因之间的相关性。结果WGCNA筛选出食管鳞癌放射敏感相关的4个核心microRNAs;qRT-PCR发现,miR-29b-3p、miR-146b-5p及miR-155-5p在食管鳞癌放射抗拒细胞株中表达下调。miR-29b-3p、miR-146b-5p联合miR-155-5p可较准确地预测食管鳞癌放射敏感性。诺曼图结果提示,miR-29b-3p是影响晚期食管鳞癌患者预后的最重要因素。过表达miR-29b-3p、miR-146b-5p可抑制食管鳞癌细胞的体外增殖力并增强其放射敏感性。TargetScan数据库及Western blotting结果提示,miR-29b-3p与miR-146b-5p分别靶向作用于H2AX和ATR的mRNA,抑制电离辐射后细胞内γH2AX和ATR的表达。结论依据miR-29b-3p、miR-146b-5p及miR-155-5p可较好地预测食管鳞癌患者的放疗效果;miR-29b-3p、miR-146b-5p通过分别靶向作用于DNA损伤识别蛋白ATR及H2AX,发挥放射增敏作用。