Frustration in Fuzzy Protein Complexes Leads to Interaction Versatility.
Frustration in Fuzzy Protein Complexes Leads to Interaction Versatility.
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DOI：
10.1021/acs.jpcb.0c11068
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发表时间：
2021-03-18
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Fuxreiter M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Freiberger MI;Wolynes PG;Ferreiro DU;Fuxreiter M
无序的蛋白质经常作为相互作用的枢纽，涉及各种有限的合作伙伴。具有不同伴侣的复合物经常表现出不同的结合模式，涉及在结合状态下保持无序的区域。虽然无序蛋白质的构象特性在其游离状态下得到了很好的表征，但对于特异性不是通过一个而是通过多个伴侣来实现的分子机制知之甚少。利用能量景观理论的概念，蛋白质挫折，我们表明，复杂的无序蛋白质表现出高度的局部挫折，特别是在结合界面。这些次优的相互作用导致了多个绑定子状态的可能性，每个子状态都显示出不同的挫折模式，这些模式在与不同合作伙伴的复合体中以不同的方式填充。这些结果解释了如何在没有单一共同结合构象的情况下实现无序蛋白质的特异性，以及如何利用不同相互作用之间的冲突来控制与多个伴侣的结合。
Disordered proteins frequently serve as interaction hubs involving a constrained variety of partners. Complexes with different partners frequently exhibit distinct binding modes, involving regions that remain disordered in the bound state. While the conformational properties of disordered proteins are well-characterized in their free states, less is known about the molecular mechanisms by which specificity can be achieved not with one but with multiple partners. Using the energy landscape theory concept of protein frustration, we demonstrate that complexes of disordered proteins exhibit a high degree of local frustration, especically at the binding interface. These suboptimal interactions lead to the possibility of multiple bound substates, each displaying distinct frustration patterns, which are differently populated in complexes with different partners. These results explain how specificity of disordered proteins can be achieved without a single common bound conformation and how the confliict between different interactions can be used to control the binding to multiple partners.
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影响因子：
64.5
作者：
Manglik A;Kim TH;Masureel M;Altenbach C;Yang Z;Hilger D;Lerch MT;Kobilka TS;Thian FS;Hubbell WL;Prosser RS;Kobilka BK
通讯作者：
Kobilka BK
影响因子：
14.9
作者：
Parra RG;Schafer NP;Radusky LG;Tsai MY;Guzovsky AB;Wolynes PG;Ferreiro DU
通讯作者：
Ferreiro DU
对动力学研究的耦合折叠和结合机制的见解。
DOI：
10.1074/jbc.r115.692715
发表时间：
2016-03-25
期刊：
The Journal of biological chemistry
影响因子：
--
作者：
Shammas SL;Crabtree MD;Dahal L;Wicky BI;Clarke J
通讯作者：
Clarke J
DOI：
10.1073/pnas.0709915104
发表时间：
2007-12-11
影响因子：
11.1
作者：
Ferreiro, Diego U.;Hegler, Joseph A.;Wolynes, Peter G.
通讯作者：
Wolynes, Peter G.
影响因子：
56.9
作者：
FRAUENFELDER, H;SLIGAR, SG;WOLYNES, PG
通讯作者：
WOLYNES, PG